RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 PLCB3Q01970 1234 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SLMAPQ14BN4 828 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 NAA25Q14CX7 972 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 UPP1Q16831 310 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC26A9Q7LBE3 791 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC25Q86WR0 208 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 RFX6Q8HWS3 928 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 PARP9Q8IXQ6 854 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 PAAF1Q9BRP4 392 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 DUSP16Q9BY84 665 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TRPV6Q9H1D0 765 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 STARD7Q9NQZ5 370 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 NEU2Q9Y3R4 380 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SQORQ9Y6N5 450 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TSC2P49815 1807 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 H0YGN5 161 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CLDN5O00501 218 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 MYZAPP0CAP1 466 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 IVDP26440 423 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SCNN1AP37088 669 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 RPL34P49207 117 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CDR1P51861 262 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ITGA8P53708 1063 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF844Q08AG5 666 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 IFFO1Q0D2I5 559 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ADIGQ0VDE8 80 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TAZQ16635 292 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 KCTD16Q68DU8 428 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 LHX8Q68G74 356 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 BBS12Q6ZW61 710 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 PIGZQ86VD9 579 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TTC13Q8NBP0 860 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ACTL9Q8TC94 416 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CCHCR1Q8TD31 782 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SYT15Q9BQS2 421 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CENPHQ9H3R5 247 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 UBN1Q9NPG3 1134 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 NFS1Q9Y697 457 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TP73O15350 636 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 FKTNO75072 461 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 B3GAT3O94766 335 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ODC1P11926 461 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 KLRC2P26717 231 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 GRK4P32298 578 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 VEGFBP49765 207 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CAV1Q03135 178 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 DEUP1Q05D60 604 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 KRT81Q14533 505 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGEF6Q15052 776 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 OASLQ15646 514 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 KIAA0319Q5VV43 1072 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 DENND2CQ68D51 928 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 PRUNE1Q86TP1 453 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ALLCQ8N6M5 410 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 BBOF1Q8ND07 529 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CRTAC1Q9NQ79 661 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 KRT82Q9NSB4 513 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ANAPC5Q9UJX4 755 aa10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 I3L4J1 428 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SGK1O00141 431 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ITGAVP06756 1048 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 RARGP13631 454 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 PTPN9P43378 593 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ARSEP51690 589 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 MMRN1Q13201 1228 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TUSC3Q13454 348 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 DPYSL3Q14195 570 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 P3H1Q32P28 736 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TIGD5Q53EQ6 642 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 BOLA3Q53S33 107 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 EFHC1Q5JVL4 640 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 IZUMO3Q5VZ72 239 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 CLEC20AQ6ZU45 233 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 PAQR9Q6ZVX9 377 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ECHDC2Q86YB7 292 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 MAP7D3Q8IWC1 876 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SH2D3CQ8N5H7 860 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC35B2Q8TB61 432 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM149B1Q96BN6 582 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TBCBQ99426 244 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM121Q9BTD3 319 aa10.41□□□□□ -0.74
LRRTM4-202ENST00000409093 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms