RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 TBX18O95935 607 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 IRF1P10914 325 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 RARGP13631 454 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC6A11P48066 632 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC8A3P57103 927 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 CUL2Q13617 745 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 C2orf27AQ580R0 203 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 C12orf40Q86WS4 652 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
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ANKRD54-203ENST00000407117 ARHGEF4Q9NR80 690 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 CLIC5Q9NZA1 410 aa29.24■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 DNMT3LQ9UJW3 386 aa29.24■■■□□ 2.27
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ANKRD54-203ENST00000407117 SEC13P55735 322 aa29.23■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa29.23■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKRD52Q8NB46 1076 aa29.23■■■□□ 2.27
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ANKRD54-203ENST00000407117 SEMA4GQ9NTN9 838 aa29.23■■■□□ 2.27
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ANKRD54-203ENST00000407117 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa29.22■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 PMM2O15305 246 aa29.22■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 GREM1O60565 184 aa29.22■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 RALAP11233 206 aa29.22■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 CD44P16070 742 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 TNFRSF4P43489 277 aa29.22■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 PLA2G4AP47712 749 aa29.22■■■□□ 2.27
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ANKRD54-203ENST00000407117 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa29.22■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 WBP2Q969T9 261 aa29.22■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
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ANKRD54-203ENST00000407117 C10orf120Q5SQS8 335 aa29.21■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 TTI2Q6NXR4 508 aa29.21■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 NUDT18Q6ZVK8 323 aa29.21■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 SCD5Q86SK9 330 aa29.21■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM25Q86YD3 366 aa29.21■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 ARHGAP18Q8N392 663 aa29.21■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 PHTF2Q8N3S3 785 aa29.21■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 DEC1Q9P2X7 70 aa29.21■■■□□ 2.27
ANKRD54-203ENST00000407117 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
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ANKRD54-203ENST00000407117 MORC3Q14149 939 aa29.2■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 CRY1Q16526 586 aa29.2■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 ANO4Q32M45 955 aa29.2■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC40Q4G0X9 1142 aa29.2■■■□□ 2.26
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ANKRD54-203ENST00000407117 KBTBD6Q86V97 674 aa29.2■■■□□ 2.26
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ANKRD54-203ENST00000407117 KCNV2Q8TDN2 545 aa29.2■■■□□ 2.26
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ANKRD54-203ENST00000407117 BMP6P22004 513 aa29.19■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 KDSRQ06136 332 aa29.19■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 SGO2Q562F6 1265 aa29.19■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 KLHL10Q6JEL2 608 aa29.19■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 RASSF3Q86WH2 238 aa29.19■■■□□ 2.26
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ANKRD54-203ENST00000407117 MARK1Q9P0L2 795 aa29.19■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 WDR35Q9P2L0 1181 aa29.19■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 KIAA1257Q9ULG3 409 aa29.19■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 P4HA2O15460 535 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 EPN2O95208 641 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 BCAT1P54687 386 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 CETN1Q12798 172 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 EOGTQ5NDL2 527 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 PRR23CQ6ZRP0 262 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 C11orf74Q86VG3 221 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 TTC30AQ86WT1 665 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 SFTPA1Q8IWL2 248 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC33Q8N5R6 958 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 ALLCQ8N6M5 410 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 NAT16Q8N8M0 369 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 NELFBQ8WX92 580 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 HESX1Q9UBX0 185 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 NUDT5Q9UKK9 219 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 TSPAN16Q9UKR8 245 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 TBC1D3BA6NDS4 549 aa29.17■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 ALDH1A2O94788 518 aa29.17■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 TIE1P35590 1138 aa29.17■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 COG7P83436 770 aa29.17■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 ELF2Q15723 593 aa29.17■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa29.17■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 PLK5Q496M5 336 aa29.17■■■□□ 2.26
ANKRD54-203ENST00000407117 UBR7Q8N806 425 aa29.17■■■□□ 2.26
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