RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380701.7

CCDC171-201, Transcript of coiled-coil domain containing 171, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC171, Length 6,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171-201ENST00000380701 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.4□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.4□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 ARHGEF9O43307 516 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 PROSCO94903 275 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 CDC25CP30307 473 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 TKTL1P51854 596 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 CUL3Q13618 768 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 PCSK7Q16549 785 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 CYP2A13Q16696 494 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 UBA3Q8TBC4 463 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 DERAQ9Y315 318 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 RRM2P31350 389 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 CDH17Q12864 832 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 GRB10Q13322 594 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 PLCL1Q15111 1095 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 PAGE2BQ5JRK9 111 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 WLSQ5T9L3 541 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 KLHL35Q6PF15 583 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 MIB1Q86YT6 1006 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 HSFY1Q96LI6 401 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 APOL5Q9BWW9 433 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 WHRNQ9P202 907 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 DTNBO60941 627 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 GCATO75600 419 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 TPBGLP0DKB5 382 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 SLC2A4P14672 509 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 PTPRAP18433 802 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 YY1P25490 414 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 ACOT1Q86TX2 421 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 HORMAD1Q86X24 394 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 ZNF333Q96JL9 665 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 ASAH2Q9NR71 780 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 RNF112Q9ULX5 631 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 TEX33O43247 280 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 FKBP9O95302 570 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 PYGMP11217 842 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 FAM171A1Q5VUB5 890 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 BTNL9Q6UXG8 535 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 USP45Q70EL2 814 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 FAM162AQ96A26 154 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 ISCUQ9H1K1 167 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 A0A087WWV3 80 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 MAGEC1O60732 1142 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 SHMT1P34896 483 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 GPC1P35052 558 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 COILP38432 576 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 THOP1P52888 689 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 SULT2A1Q06520 285 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 CDK20Q8IZL9 346 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 ABRAQ8N0Z2 381 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 SLC30A5Q8TAD4 765 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 FAM172AQ8WUF8 416 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 GLMNQ92990 594 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 SENP2Q9HC62 589 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 CDH9Q9ULB4 789 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 MPOP05164 745 aa7.38□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 RPL3P39023 403 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 AIF1P55008 147 aa7.38□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 DMC1Q14565 340 aa7.38□□□□□ -1.23
CCDC171-201ENST00000380701 USP41Q3LFD5 358 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms