RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378402.9

PKHD1L1-201, Transcript of PKHD1 like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKHD1L1, Length 13,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC12A1Q13621 1099 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 GALNT3Q14435 633 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 AKAP4Q5JQC9 854 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 WDR44Q5JSH3 913 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 RABGAP1LQ5R372 815 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 CAPN12Q6ZSI9 719 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 PIGWQ7Z7B1 504 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 AACSQ86V21 672 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 FRS2Q8WU20 508 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPP1R14AQ96A00 147 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF232Q9UNY5 417 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 CFL2Q9Y281 166 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A088AWK7 358 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 IRGMA1A4Y4 181 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF213O14771 459 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 SNX4O95219 450 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 SPARCP09486 303 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 MPP1Q00013 466 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 WDR72Q3MJ13 1102 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 WAPLQ7Z5K2 1190 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 PLD5Q8N7P1 536 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 LINC00301Q8NCQ3 95 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 C7orf34Q96L11 122 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 A2ML1A8K2U0 1454 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ATP9AO75110 1047 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 SURF6O75683 361 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 INHBAP08476 426 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 UMPSP11172 480 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 STK11Q15831 433 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 EFHC1Q5JVL4 640 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 CALML5Q9NZT1 146 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 MGAT4BQ9UQ53 548 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ADGRB2O60241 1585 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A0D9SFI3 127 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A0G2JPF8 293 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 GNPATO15228 680 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAM189A1O60320 539 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 SUPT3HO75486 399 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ARFIP1P53367 373 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCNMA1Q12791 1236 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 USP38Q8NB14 1042 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 AIFM3Q96NN9 605 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCNN3Q9UGI6 736 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 PTPRUQ92729 1446 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 WDR62O43379 1518 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 CAMTA2O94983 1202 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 THRAP10827 490 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 RPS6P62753 249 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 CHRNEQ04844 493 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 KLHL30Q0D2K2 578 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC18A3Q16572 532 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 TLDC1Q6P9B6 456 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAM109AQ8N4B1 249 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 CCDC24Q8N4L8 307 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 KRT35Q92764 455 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ERP44Q9BS26 406 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 HOXC10Q9NYD6 342 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 PGAP2Q9UHJ9 254 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 OPN1LWP04000 364 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 COL6A1P12109 1028 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 IL18R1Q13478 541 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 MPP7Q5T2T1 576 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 PIK3R6Q5UE93 754 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 IQCHQ86VS3 1027 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 SCUBE3Q8IX30 993 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 SFRP1Q8N474 314 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 TSPAN14Q8NG11 270 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR7A2PQ8NGA2 310 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 NDNFQ8TB73 568 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCNB2Q92953 911 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 CHID1Q9BWS9 393 aa3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 CD248Q9HCU0 757 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms