RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 OTUB2Q96DC9 234 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 NMUR1Q9HB89 426 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CYLDQ9NQC7 956 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 OSER1Q9NX31 292 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 NCDNQ9UBB6 729 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 NAGPAQ9UK23 515 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.07□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PMM2O15305 246 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 P4HA2O15460 535 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TBX18O95935 607 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ADH5P11766 374 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 RARGP13631 454 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CD19P15391 556 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 HOXA6P31267 233 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 HOXC13P31276 330 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 BCAT1P54687 386 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 KDSRQ06136 332 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA8FQ08AF8 430 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL40Q2TBA0 621 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SGO2Q562F6 1265 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf120Q5SQS8 335 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 LY6G5CQ5SRR4 150 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TTC30AQ86WT1 665 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 FAM114A1Q8IWE2 563 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 UBR7Q8N806 425 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 WBP2Q969T9 261 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ACDQ96AP0 544 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 NT5C1BQ96P26 610 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ANO10Q9NW15 660 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 HESX1Q9UBX0 185 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 RWDD2AQ9UIY3 292 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 RAB23Q9ULC3 237 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 USP3Q9Y6I4 520 aa8.06□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 K7EQS6 105 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 O00370 1275 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 MDM4O15151 490 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 KAT7O95251 611 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CAVIN2O95810 425 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SETSIPP0DME0 302 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC192P0DO97 292 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 RALAP11233 206 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CNR2P34972 360 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TKTL1P51854 596 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SEC13P55735 322 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 GCNT1Q02742 428 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PDE4CQ08493 712 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 MESP2Q0VG99 397 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 KCNH2Q12809 1159 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 DSG2Q14126 1118 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 LPAL2Q16609 132 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 STX1AQ16623 288 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 RAB41Q5JT25 222 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM270Q6UE05 265 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SYT13Q7L8C5 426 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SCD5Q86SK9 330 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PIGZQ86VD9 579 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 C12orf40Q86WS4 652 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 MIB1Q86YT6 1006 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP18Q8N392 663 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 DCLK2Q8N568 766 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 LMO3Q8TAP4 145 aa8.05□□□□□ -1.12
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