RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-201ENST00000345716 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-201ENST00000345716 PCDHGB4Q9UN71 923 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-201ENST00000345716 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NISCH-201ENST00000345716 E5RJQ4 531 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-201ENST00000345716 STRA8Q7Z7C7 330 aa21.41■■□□□ 1.02
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NISCH-201ENST00000345716 TMEM169Q96HH4 297 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-201ENST00000345716 H7C4K7 107 aa21.4■■□□□ 1.02
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NISCH-201ENST00000345716 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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NISCH-201ENST00000345716 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.4■■□□□ 1.02
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NISCH-201ENST00000345716 AGAP9Q5VTM2 703 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-201ENST00000345716 MRNIPQ6NTE8 343 aa21.4■■□□□ 1.02
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NISCH-201ENST00000345716 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.4■■□□□ 1.02
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NISCH-201ENST00000345716 AMPD1P23109 780 aa21.4■■□□□ 1.02
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NISCH-201ENST00000345716 CAPSQ13938 189 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-201ENST00000345716 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-201ENST00000345716 CYB5D1Q6P9G0 228 aa21.4■■□□□ 1.02
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NISCH-201ENST00000345716 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
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NISCH-201ENST00000345716 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.39■■□□□ 1.02
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NISCH-201ENST00000345716 COPAP53621 1224 aa21.39■■□□□ 1.02
NISCH-201ENST00000345716 FMO1Q01740 532 aa21.39■■□□□ 1.02
NISCH-201ENST00000345716 OVOS1Q6IE37 1185 aa21.39■■□□□ 1.02
NISCH-201ENST00000345716 FICDQ9BVA6 458 aa21.39■■□□□ 1.02
NISCH-201ENST00000345716 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
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NISCH-201ENST00000345716 DEFB106AQ8N104 65 aa21.39■■□□□ 1.01
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NISCH-201ENST00000345716 CHST12Q9NRB3 414 aa21.39■■□□□ 1.01
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NISCH-201ENST00000345716 PTPN7P35236 360 aa21.38■■□□□ 1.01
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NISCH-201ENST00000345716 MED21Q13503 144 aa21.38■■□□□ 1.01
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NISCH-201ENST00000345716 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 HTR3CQ8WXA8 447 aa21.38■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 APOL5Q9BWW9 433 aa21.38■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 KIF17Q9P2E2 1029 aa21.38■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 SUPT7LO94864 414 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-201ENST00000345716 APOC2P02655 101 aa21.37■■□□□ 1.01
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