RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 SGF29Q96ES7 293 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 MARC1Q5VT66 337 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 FAR2Q96K12 515 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM111AQ96PZ2 611 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 SHOC2Q9UQ13 582 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 MICAL2O94851 1124 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM107AO95990 144 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 TUFMP49411 452 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 PTENP60484 403 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 MTMR8Q96EF0 704 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 CLPBQ9H078 707 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 YWHAQP27348 245 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC26A11Q86WA9 606 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 OOSP2Q86WS3 158 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 NUP93Q8N1F7 819 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC2A14Q8TDB8 520 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNV2Q8TDN2 545 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 EDEM1Q92611 657 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 TNFSF13BQ9Y275 285 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 RAMP2O60895 175 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 IRAK1P51617 712 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 GTF2BQ00403 316 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF208Q9H0X6 261 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 GIMAP4Q9NUV9 329 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 CBX4O00257 560 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 PLA2G6O60733 806 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 AMHP03971 560 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINF2P08697 491 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 RFWD2Q8NHY2 731 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAM2Q99965 735 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 FICDQ9BVA6 458 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 NT5MQ9NPB1 228 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 NMRK1Q9NWW6 199 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC24A2Q9UI40 661 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC10BA6NIK2 292 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 SUPT7LO94864 414 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 RENBPP51606 427 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 BEX3Q00994 111 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 TATDN1Q6P1N9 297 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 UNC93AQ86WB7 457 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 IFNEQ86WN2 208 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 PNKPQ96T60 521 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEB16A2A368 324 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.297e-22■■■□□ 19.1
SH3BP4-201ENST00000344528 AIM2O14862 343 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 MYL4P12829 197 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 RFX8Q6ZV50 586 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 C3orf20Q8ND61 904 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 CIPCQ9C0C6 399 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 EVPLLA8MZ36 301 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 GLRA2P23416 452 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V1E1P36543 226 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 CDH8P55286 799 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJC3Q13217 504 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 PTF1AQ7RTS3 328 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 DPF3Q92784 378 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 GAD1Q99259 594 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 PLA2G4CQ9UP65 541 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 USP20Q9Y2K6 914 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 CES2O00748 559 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 OCA2Q04671 838 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 SGO1Q5FBB7 561 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 APBB2Q92870 758 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 B2RBV5 119 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC6A3Q01959 620 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP2K5Q13163 448 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 MPP3Q13368 585 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 RBBP8Q99708 897 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 APOL2Q9BQE5 337 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 NMRK2Q9NPI5 230 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 SELENONQ9NZV5 590 aa16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4-201ENST00000344528 MAFO75444 373 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 NR2C2P49116 596 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC33Q8N5R6 958 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 KLC4Q9NSK0 619 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF112Q9ULX5 631 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP3K10Q02779 954 aa16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms