RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.63■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 RTP4Q96DX8 246 aa22.63■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.63■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 ZBED1O96006 694 aa22.62■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 FAM163BP0C2L3 166 aa22.62■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 KRT15P19012 456 aa22.62■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 STX2P32856 288 aa22.62■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 GNASQ5JWF2 1037 aa22.62■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.62■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 ZFP42Q96MM3 310 aa22.62■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.62■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.62■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.61■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 ADCY1Q08828 1119 aa22.61■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 KCNJ11Q14654 390 aa22.61■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 PIGZQ86VD9 579 aa22.61■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 SGSM3Q96HU1 749 aa22.61■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.61■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.61■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.61■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.61■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 RBL1P28749 1068 aa22.61■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.61■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 TRPV1Q8NER1 839 aa22.61■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 TRABDQ9H4I3 376 aa22.61■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.61■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 GJA9P57773 515 aa22.6■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 HACE1Q8IYU2 909 aa22.6■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 FUKQ8N0W3 1084 aa22.6■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.6■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.6■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.6■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.6■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 PCNTO95613 3336 aa22.6■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 ATP2C2O75185 946 aa22.6■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 WSCD1Q658N2 575 aa22.6■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 FBF1Q8TES7 1133 aa22.6■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 MAGEB18Q96M61 343 aa22.6■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 SMC6Q96SB8 1091 aa22.6■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.215e-6■□□□□ 8.1
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SPHK1-201ENST00000323374 NPR3P17342 541 aa22.59■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 SLC18A1P54219 525 aa22.59■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 ADIGQ0VDE8 80 aa22.59■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.59■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 IL9RQ01113 521 aa22.58■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 MTM1Q13496 603 aa22.58■■□□□ 1.21
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SPHK1-201ENST00000323374 CCDC185Q8N715 623 aa22.58■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.58■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 KLC2Q9H0B6 622 aa22.58■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 CHST12Q9NRB3 414 aa22.58■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.58■■□□□ 1.21
SPHK1-201ENST00000323374 CLDN5O00501 218 aa22.58■■□□□ 1.2
SPHK1-201ENST00000323374 MAP3K6O95382 1288 aa22.58■■□□□ 1.2
SPHK1-201ENST00000323374 CTGFP29279 349 aa22.58■■□□□ 1.2
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