RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PRRG1O14668 218 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 CEP104O60308 925 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 NCAM1P13591 858 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PBX2P40425 430 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 ALDH1A3P47895 512 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 SULT1E1P49888 294 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC181Q5TID7 509 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 CEP112Q8N8E3 955 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 FBXO32Q969P5 355 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 TBCBQ99426 244 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 H3BNC9 293 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 GRM6O15303 877 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 LPXNO60711 386 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 ENDOD1O94919 500 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 GJC1P36383 396 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PAFAH1B1P43034 410 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 HDAC4P56524 1084 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 BNIPLQ7Z465 357 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 SCD5Q86SK9 330 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 GIPC2Q8TF65 315 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 TGM5O43548 720 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PRPSAP2O60256 369 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 CSH1P0DML2 217 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 CSH2P0DML3 217 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 IL1R2P27930 398 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PSEN1P49768 467 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 MTMR3Q13615 1198 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 CLUL1Q15846 466 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 LILRA6Q6PI73 481 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 MNS1Q8NEH6 495 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 EXD1Q8NHP7 514 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 EDEM1Q92611 657 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 MS4A14Q96JA4 679 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 CARD6Q9BX69 1037 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 A0A1W2PQH9 124 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 HIDE1A8MVS5 230 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 SLU7O95391 586 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PYGMP11217 842 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 KLRC2P26717 231 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PLD1Q13393 1074 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 GPM6BQ13491 265 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 CAMK1Q14012 370 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 VEPH1Q14D04 833 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 RAB6CQ53S08 254 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 NMUR1Q9HB89 426 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 GMIPQ9P107 970 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 M0QYT0 321 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 C1RP00736 705 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 TAF10Q12962 218 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 BOLA3Q53S33 107 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PEBP4Q96S96 227 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 ZWILCHQ9H900 591 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 GLUD1P00367 558 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 KRT1P04264 644 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 EPHB3P54753 998 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 TWF1Q12792 350 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 SCYL2Q6P3W7 929 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms