RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
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SPNS1-201ENST00000311008 NR2C2P49116 596 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 DGKDQ16760 1214 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 RAB6CQ53S08 254 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF276Q8N554 614 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM237Q96Q45 408 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.33■□□□□ 0.85
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SPNS1-201ENST00000311008 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
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SPNS1-201ENST00000311008 KIF2BQ8N4N8 673 aa20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 YY1AP1Q9H869 796 aa20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 A6NJR5 290 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 KRT37O76014 449 aa20.32■□□□□ 0.84
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SPNS1-201ENST00000311008 NEK3P51956 506 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 NRLP54845 237 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 DPYSL2Q16555 572 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 NOTUMQ6P988 496 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC6Q86X45 466 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 SNTG2Q9NY99 539 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 WFS1O76024 890 aa20.31■□□□□ 0.84
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SPNS1-201ENST00000311008 MMP3P08254 477 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 ACADSBP45954 432 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 BCAT1P54687 386 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 HDAC4P56524 1084 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 FAAP100Q0VG06 881 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 BST2Q10589 180 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.31■□□□□ 0.84
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SPNS1-201ENST00000311008 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 SAR1AQ9NR31 198 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa20.31■□□□□ 0.84
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SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA8RI6L899 631 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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SPNS1-201ENST00000311008 TGDSO95455 350 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 IL1BP01584 269 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 FGFR1P11362 822 aa20.31■□□□□ 0.84
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SPNS1-201ENST00000311008 CYP2F1P24903 491 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 MTM1Q13496 603 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 SH2D5Q6ZV89 423 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 VPS52Q8N1B4 723 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 TUBB6Q9BUF5 446 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM55Q9BYV6 548 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 CNTN3Q9P232 1028 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 SLC17A7Q9P2U7 560 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 CD4P01730 458 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 ETV4P43268 484 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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SPNS1-201ENST00000311008 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 CFAP36Q96G28 342 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 A8MXQ7 604 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 PIAS1O75925 651 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 APRTP07741 180 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 TPSB2P20231 275 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 MAP2K2P36507 400 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 E2F5Q15329 346 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 TPSAB1Q15661 275 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 CA9Q16790 459 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-201ENST00000311008 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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