RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FBXW8Q8N3Y1 598 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRPC4APQ8TEL6 797 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CBWD1Q9BRT8 395 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GINM1Q9NU53 330 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HSPBP1Q9NZL4 362 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 APPL1Q9UKG1 709 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A0B4J269 797 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HTR3EA5X5Y0 456 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IFNB1P01574 187 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PROCP04070 461 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GJC1P36383 396 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RELAQ04206 551 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GAD2Q05329 585 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TUBB3Q13509 450 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CES4AQ5XG92 561 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KCTD1Q719H9 257 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TICAM1Q8IUC6 712 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDIK1LQ8N165 341 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 APBB2Q92870 758 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CNBD2Q96M20 576 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PHF12Q96QT6 1004 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MECRQ9BV79 373 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OSBPL6Q9BZF3 934 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 278.3
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PCDHGB4Q9UN71 923 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 K7ENM7 598 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPAG6O75602 509 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAPTP10636 758 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KITP10721 976 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF23P17027 643 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ECE1P42892 770 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NUP107P57740 925 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MTMR2Q13614 643 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MFSD7Q6UXD7 560 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CPA5Q8WXQ8 436 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ITPKCQ96DU7 683 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NACC1Q96RE7 527 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCT7Q99832 543 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EBF4Q9BQW3 602 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM121Q9BTD3 319 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RRN3Q9NYV6 651 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FZD9O00144 591 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 L1CAMP32004 1257 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LLGL2Q6P1M3 1020 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IYDQ6PHW0 289 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NUDCD3Q8IVD9 361 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 POU5F2Q8N7G0 328 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADCY4Q8NFM4 1077 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC35B2Q8TB61 432 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ACCSQ96QU6 501 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KCNK16Q96T55 309 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PGAP2Q9UHJ9 254 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF180Q9UJW8 692 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SQORQ9Y6N5 450 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZBTB39O15060 712 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RBP3P10745 1247 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HALP42357 657 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NAA20P61599 178 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAMLD1Q13495 774 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARCQ7LC44 396 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OTOP1Q7RTM1 612 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM83AQ86UY5 434 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HPS6Q86YV9 775 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GIPC3Q8TF64 312 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CMTM5Q96DZ9 223 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VCPIP1Q96JH7 1222 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COX4I2Q96KJ9 171 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KLC2Q9H0B6 622 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM8AQ9HCN3 771 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 THAP1Q9NVV9 213 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 USTQ9Y2C2 406 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EFR3BQ9Y2G0 817 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FADS3Q9Y5Q0 445 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SCINQ9Y6U3 715 aa18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TISP43B9A030 160 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PI4K2BG5E9Z4 385 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KRT1P04264 644 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CYP3A4P08684 503 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KRT5P13647 590 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PHKA2P46019 1235 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ALDH3B2P48448 385 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms