RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299240.10

TTC17-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC17, Length 3,648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-202ENST00000299240 KCNE1P15382 129 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 HDAC4P56524 1084 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 EFEMP1Q12805 493 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 LRRC14Q15048 493 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 OLFML1Q6UWY5 402 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 PAQR9Q6ZVX9 377 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 RASGEF1CQ8N431 466 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 ATL2Q8NHH9 583 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 RSPH1Q8WYR4 309 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 RAB6BQ9NRW1 208 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 ADAM21Q9UKJ8 722 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 SLC4A1P02730 911 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 RBL1P28749 1068 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 INCA1Q0VD86 236 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 DUSP16Q9BY84 665 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 CNTN6Q9UQ52 1028 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 GIT1Q9Y2X7 761 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 CDY1Q9Y6F8 540 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 GOLGA8RI6L899 631 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 ENPP3O14638 875 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 PCSK1P29120 753 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 GUCY1A3Q02108 690 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 BTBD8Q5XKL5 378 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 CTAGE3PQ8IX95 158 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 EXD1Q8NHP7 514 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 TMEM174Q8WUU8 243 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 VCPIP1Q96JH7 1222 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 ARID2Q68CP9 1835 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 FAM72CH0Y354 149 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 DFFAO00273 331 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 AMHP03971 560 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 EPHB2P29323 1055 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 ARL4AP40617 200 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 CDKN2BP42772 138 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 FAM72AQ5TYM5 149 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 FAM72DQ6L9T8 149 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 FAM72BQ86X60 149 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 PXYLP1Q8TE99 480 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 SEPT8Q92599 483 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 LHX5Q9H2C1 402 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 GDF3Q9NR23 364 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 PMS2P54278 862 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 BFSP2Q13515 415 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 RNF139Q8WU17 664 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 CFAP36Q96G28 342 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 PIGVQ9NUD9 493 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 MPP6Q9NZW5 540 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 A0A0G2JMZ2 1700 aa13.13□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 MOXD2PA6NHM9 499 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 PSTPIP1O43586 416 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 ENDOD1O94919 500 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 MYZAPP0CAP1 466 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 SP100P23497 879 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 OR1D2P34982 312 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 EMBQ6PCB8 327 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 CES3Q6UWW8 571 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 EP400NLQ6ZTU2 488 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 MAP7D3Q8IWC1 876 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 FAF2Q96CS3 445 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 WDR35Q9P2L0 1181 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 ADAM12O43184 909 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 MGAT3Q09327 533 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 ANKRD22Q5VYY1 191 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 ATXN3LQ9H3M9 355 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 FAM114A2Q9NRY5 505 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 TMEM59LQ9UK28 342 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 CHMP2BQ9UQN3 213 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 AGPSO00116 658 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 FSCN2O14926 492 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 SLC11A1P49279 550 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 ITKQ08881 620 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 NT5DC4Q86YG4 428 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 ZMIZ2Q8NF64 920 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 FAM76AQ8TAV0 307 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 LRRC45Q96CN5 670 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 TKTL2Q9H0I9 626 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TTC17-202ENST00000299240 BNIP3LO60238 219 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms