RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 MIPEPQ99797 713 aa29.11■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 E5RJQ4 531 aa29.1■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 BGNP21810 368 aa29.1■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 PRKCHP24723 683 aa29.1■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB16Q05516 673 aa29.1■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 C4orf50Q6ZRC1 276 aa29.1■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 TBCBQ99426 244 aa29.1■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 IFT122Q9HBG6 1241 aa29.1■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 ARL8BQ9NVJ2 186 aa29.1■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 ITGA11Q9UKX5 1188 aa29.1■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 AVILO75366 819 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 SLC25A27O95847 323 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 ZBED1O96006 694 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 OSBPP22059 807 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 SERPINB3P29508 390 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 NDST1P52848 882 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 POPDC2Q9HBU9 364 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 MKS1Q9NXB0 559 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 TRIM49D1C9J1S8 452 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 IL4RP24394 825 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 BCAR1P56945 870 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 TMEM132DQ14C87 1099 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 SLC9A4Q6AI14 798 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 TEX9Q8N6V9 391 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.251e-8■■■□□ 18.6
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UBP1-201ENST00000283628 TSPAN16Q9UKR8 245 aa29.09■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 ZNF487B1APH4 448 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 C22orf31O95567 290 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 CCDC14Q49A88 953 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 CCDC62Q6P9F0 684 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 PPM1NQ8N819 430 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 MCUQ8NE86 351 aa29.08■■■□□ 2.25
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UBP1-201ENST00000283628 ETNK2Q9NVF9 386 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 DESP17661 470 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 CYP3A5P20815 502 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 AMHR2Q16671 573 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 CDO1Q16878 200 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 DPH6Q7L8W6 267 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 CTAGE3PQ8IX95 158 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 PQLC3Q8N755 202 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 AFG1LQ8WV93 481 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 NT5C1AQ9BXI3 368 aa29.08■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 CCNFP41002 786 aa29.07■■■□□ 2.24
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UBP1-201ENST00000283628 SLC10A6Q3KNW5 377 aa29.07■■■□□ 2.24
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UBP1-201ENST00000283628 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
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UBP1-201ENST00000283628 RAB6CQ9H0N0 254 aa29.07■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 PCDH18Q9HCL0 1135 aa29.07■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 PLLPQ9Y342 182 aa29.07■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 C2CD2Q9Y426 696 aa29.07■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 EVPLQ92817 2033 aa29.07■■■□□ 2.24
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UBP1-201ENST00000283628 GSC2O15499 205 aa29.06■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 ENTPD5O75356 428 aa29.06■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 RBL1P28749 1068 aa29.06■■■□□ 2.24
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UBP1-201ENST00000283628 ZNF484Q5JVG2 852 aa29.06■■■□□ 2.24
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UBP1-201ENST00000283628 C7orf26Q96N11 449 aa29.06■■■□□ 2.24
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UBP1-201ENST00000283628 I3L4J1 428 aa29.06■■■□□ 2.24
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UBP1-201ENST00000283628 MYL2P10916 166 aa29.05■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 SDC4P31431 198 aa29.05■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 CDK18Q07002 472 aa29.05■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 SCYL2Q6P3W7 929 aa29.05■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 OLFML1Q6UWY5 402 aa29.05■■■□□ 2.24
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