RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260356.5

THBS1-201, Transcript of thrombospondin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS1, Length 7,775 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1-201ENST00000260356 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 CDHR2Q9BYE9 1310 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 HBP1O60381 514 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 TPBGLP0DKB5 382 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 CCZ1BP86790 482 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ZNF543Q08ER8 600 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 CYP4A22Q5TCH4 519 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 STRA8Q7Z7C7 330 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 RORBQ92753 470 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 HNMTP50135 292 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 PRKCEQ02156 737 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 PMF1Q6P1K2 205 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 COL15A1P39059 1388 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 F5H5T6 163 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 M0QYT0 321 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 TRPC4Q9UBN4 977 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 UPP2O95045 317 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 S100A9P06702 114 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 CPT1AP50416 773 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 CSNK2BP67870 215 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 CASP12Q6UXS9 341 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 VCPKMTQ9H867 229 aa11.76□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 MFN2O95140 757 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 TNFAIP8O95379 198 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 PCNAP12004 261 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 HMGCS2P54868 508 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ZNF284Q2VY69 593 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 DENND6AQ8IWF6 608 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 KIAA1257Q9ULG3 409 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 SNX8Q9Y5X2 465 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ATG7O95352 703 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 KCNMA1Q12791 1236 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 KYQ8NBH2 561 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 SGF29Q96ES7 293 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ROGDIQ9GZN7 287 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 CD248Q9HCU0 757 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 PDGFCQ9NRA1 345 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 TAGLN3Q9UI15 199 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 REREQ9P2R6 1566 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 VAC14Q08AM6 782 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 TMEM62Q0P6H9 643 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 SLFN11Q7Z7L1 901 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ANKRD7Q92527 254 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ELOVL6Q9H5J4 265 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 TPRKBQ9Y3C4 175 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 F9P00740 461 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 RPA1P27694 616 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 DSG3P32926 999 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 OVGP1Q12889 678 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 KCNB2Q92953 911 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 PHF20Q9BVI0 1012 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 RARGP13631 454 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 PSMB9P28065 219 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 TMEM26Q6ZUK4 368 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 COMMD2Q86X83 199 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 PHACTR4Q8IZ21 702 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 TC2NQ8N9U0 490 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 EFCAB10A6NFE3 127 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 FAM58BPP0C7Q3 252 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 AKAP5P24588 427 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 TKTP29401 623 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 TAF6P49848 677 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 DMPKQ09013 629 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 NR6A1Q15406 480 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 AGKQ53H12 422 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 XRRA1Q6P2D8 792 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 GPRASP2Q96D09 838 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 SH2D3AQ9BRG2 576 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 CASZ1Q86V15 1759 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 NRKQ7Z2Y5 1582 aa11.75□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 PRR23AA6NEV1 266 aa11.74□□□□□ -0.53
THBS1-201ENST00000260356 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms