RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
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SPCS1-201ENST00000233025 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 WASH3PC4AMC7 463 aa17.49■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 H0Y8X5 98 aa17.49■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 H0YCG3 227 aa17.49■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 RFPL3O75679 317 aa17.49■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 ACTN2P35609 894 aa17.49■□□□□ 0.39
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SPCS1-201ENST00000233025 FUT11Q495W5 492 aa17.49■□□□□ 0.39
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SPCS1-201ENST00000233025 BBS7Q8IWZ6 715 aa17.49■□□□□ 0.39
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SPCS1-201ENST00000233025 C4orf50Q6ZRC1 276 aa17.48■□□□□ 0.39
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SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC3Q13217 504 aa17.47■□□□□ 0.39
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SPCS1-201ENST00000233025 ZNF248Q8NDW4 579 aa17.46■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 CXorf38Q8TB03 319 aa17.46■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 WBP2Q969T9 261 aa17.46■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM9Q9C026 710 aa17.46■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 CRTAC1Q9NQ79 661 aa17.46■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
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SPCS1-201ENST00000233025 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa17.46■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 COCHO43405 550 aa17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 KRT10P13645 584 aa17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 ANXA13P27216 316 aa17.45■□□□□ 0.38
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SPCS1-201ENST00000233025 STARD3Q14849 445 aa17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 TEAD4Q15561 434 aa17.45■□□□□ 0.38
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SPCS1-201ENST00000233025 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 NT5DC4Q86YG4 428 aa17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 SNX19Q92543 992 aa17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 C8orf76Q96K31 380 aa17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 SYT15Q9BQS2 421 aa17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 NUP58Q9BVL2 599 aa17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM4Q9C037 500 aa17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 TM9SF3Q9HD45 589 aa17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 GDAP2Q9NXN4 497 aa17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 STON1Q9Y6Q2 735 aa17.45■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa17.44■□□□□ 0.38
SPCS1-201ENST00000233025 TISP43B9A030 160 aa17.44■□□□□ 0.38
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