RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pak1ip1Q9DCE5 382 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem8bB1AWJ5 472 aa22.72■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm973E9Q295 1059 aa22.72■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa22.72■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tlx3O55144 291 aa22.72■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pde8aO88502 823 aa22.72■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Men1O88559 611 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gja1P23242 382 aa22.72■■□□□ 1.23
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Defb34Q7TNV8 81 aa22.72■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc6a17Q8BJI1 727 aa22.72■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa22.72■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf276Q8CE64 614 aa22.72■■□□□ 1.23
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AdprmQ99KS6 340 aa22.72■■□□□ 1.23
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SetxA2AKX3 2646 aa22.71■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm45261A0A1B0GSP6 197 aa22.71■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 HccsP53702 272 aa22.71■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dpcr1Q3TNW5 500 aa22.71■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ksr1Q61097 873 aa22.71■■□□□ 1.23
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam221aQ8C790 301 aa22.71■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pcdhb2Q91Y00 799 aa22.71■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Apopt1Q9CQW7 192 aa22.71■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mms19Q9D071 1031 aa22.71■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sec13Q9D1M0 322 aa22.71■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Jph3Q9ET77 744 aa22.71■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Timp4Q9JHB3 224 aa22.71■■□□□ 1.23
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TomtA1Y9I9 258 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ttc17E9PVB5 1198 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Top6blJ3QMY9 579 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CtssO70370 340 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Serpinb6Q60854 378 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atg9bQ6EBV9 922 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tatdn1Q6P8M1 295 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PrcpQ7TMR0 491 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Elmo3Q8BYZ7 720 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Bicdl2Q8CHW5 507 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PdxkQ8K183 312 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Scrn2Q8VCA8 425 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ferd3lQ923Z4 168 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NamptQ99KQ4 491 aa22.7■■□□□ 1.22
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Asb3Q9WV72 525 aa22.7■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm3542K7N6U2 270 aa22.69■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccpg1Q640L3 753 aa22.69■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 RbfaQ6P3B9 350 aa22.69■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Acad11Q80XL6 779 aa22.69■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ints6lQ8BND4 861 aa22.69■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PigkQ9CXY9 395 aa22.69■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gadd45gQ9Z111 159 aa22.69■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 P01652 108 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 RaraP11416 462 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cetn1P41209 172 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Psmc1P62192 440 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fubp3Q3TIX6 575 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nlrc4Q3UP24 1024 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tas2r134Q7TQB0 298 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Syt15Q8C6N3 418 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hip1Q8VD75 1029 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf622Q91VY9 476 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sh3d19Q91X43 789 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Papd4Q91YI6 484 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ube2sQ921J4 223 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pde2aQ922S4 916 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kif12Q9D2Z8 642 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MesdQ9ERE7 224 aa22.68■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Igkv10-94A0A075B5L1 115 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm5580A0A0N4SVP8 411 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm6657A0A1B0GRJ3 277 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm27029A2A4P4 543 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Col9a3A2ACT7 680 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr552E9Q545 317 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ColqO35348 457 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Anks1aP59672 1150 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MybphP70402 483 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cry1P97784 606 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FancbQ5XJY6 703 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pde1cQ64338 706 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trappc6aQ78XR0 159 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cfap100Q80VN0 613 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ttc24Q8BYG0 334 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dnm3Q8BZ98 863 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cbwd1Q8VEH6 393 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trim12aQ99PQ1 284 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q9D454 513 aa22.67■■□□□ 1.22
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rab11fip1Q9D620 645 aa22.67■■□□□ 1.22
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