RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stk40Q7TNL3 435 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam78aQ8C552 283 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cabs1Q8C633 391 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8CCC3 530 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zswim3Q8CFL8 695 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr532Q8VGT4 309 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fuca2Q99KR8 461 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptdss1Q99LH2 473 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem68Q9D850 329 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DpysQ9EQF5 519 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc22a3Q9WTW5 551 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myo16Q5DU14 1919 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd16A2AS55 361 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Top6blJ3QMY9 579 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Edil3O35474 480 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GlrbP48168 496 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cav1P49817 178 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sem1P60897 70 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smpd1Q04519 627 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smyd5Q3TYX3 416 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Orai3Q6P8G8 290 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam102aQ78T81 392 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q80ZQ3 298 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr60Q8C761 999 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rell1Q8K2J7 272 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcoln2Q8K595 566 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OlahQ8R197 265 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1352Q8VGX5 309 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec63Q8VHE0 760 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akirin1Q99LF1 191 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bbs5Q9CZQ9 341 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Terb2Q9D494 218 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc33Q9D6K7 262 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rsrc1Q9DBU6 334 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cntnap5aQ0V8T9 1304 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Speer4f2E9Q366 295 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3371F7CQW8 167 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Capn6O35646 641 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VdrP48281 422 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Calb2Q08331 271 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppm1jQ149T7 507 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptcd3Q14C51 685 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3UE31 404 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc110Q3V125 848 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2700097O09RikQ6PGK3 301 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Frmd4aQ8BIE6 1020 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taf5Q8C092 801 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Apol7cQ8C6E1 369 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf208Q8K0W3 265 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Unc93b1Q8VCW4 598 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thap12Q9CUX1 758 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700123K08RikQ9D991 295 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem174Q9DCX7 243 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rdh14Q9ERI6 334 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CitP49025 2055 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm281D3Z1Y0 860 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 E030030I06RikJ3QML9 246 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 StrnO55106 780 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glud1P26443 558 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HpdP49429 393 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myl2P51667 166 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Echdc2Q3TLP5 296 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13103Q4VAD2 491 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pabpn1lQ5XFR0 273 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atl2Q6PA06 583 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1105Q7TR58 312 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf76Q8BMU0 568 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc39a13Q8BZH0 361 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpc3Q8CFZ4 579 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MgarpQ8VI64 283 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxp3Q99JB6 429 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lpin3Q99PI4 848 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Med7Q9CZB6 233 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tlr6Q9EPW9 795 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo17Q9QZM8 286 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa13.14□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm9774A0A0A6YVU8 407 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r17E9PYF5 849 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp9bP98195 1146 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf235Q61116 645 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Txndc8Q69AB2 127 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smg5Q6ZPY2 1017 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap15Q811M1 481 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnv1Q8BZN2 503 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CenpuQ8C4M7 410 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mob2Q8VI63 235 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NelfcdQ922L6 591 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Subh2bvQ9D9Z7 123 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab27aQ9ERI2 221 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 XkQ9QXY7 446 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gabbr1Q9WV18 960 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbkbp1A2A9T0 611 aa13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.1 ms