RNA–Protein interactions for RNA: YFR056C

YFR056C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFR056C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR056CYFR056C YGL258W-AQ3E740 77 aa-0.19□□□□□ -2.44
YFR056CYFR056C YOR072W-BQ3E832 53 aa-0.19□□□□□ -2.44
YFR056CYFR056C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
YFR056CYFR056C SSK2P53599 1579 aa-0.23□□□□□ -2.45
YFR056CYFR056C YPR010C-AA5Z2X5 72 aa-0.23□□□□□ -2.45
YFR056CYFR056C BUD3P25558 1636 aa-0.24□□□□□ -2.45
YFR056CYFR056C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
YFR056CYFR056C FMP27Q06179 2628 aa-0.27□□□□□ -2.45
YFR056CYFR056C YHR050W-AQ05451 56 aa-0.27□□□□□ -2.45
YFR056CYFR056C TOR2P32600 2474 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
YFR056CYFR056C FIG2P25653 1609 aa-0.29□□□□□ -2.46
YFR056CYFR056C NUP192P47054 1683 aa-0.3□□□□□ -2.46
YFR056CYFR056C THO2P53552 1597 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
YFR056CYFR056C USO1P25386 1790 aa-0.32□□□□□ -2.46
YFR056CYFR056C STU1P38198 1513 aa-0.33□□□□□ -2.46
YFR056CYFR056C ULS1Q08562 1619 aa-0.35□□□□□ -2.46
YFR056CYFR056C MEC1P38111 2368 aa-0.35□□□□□ -2.47
YFR056CYFR056C YPR117WQ06116 2489 aa-0.35□□□□□ -2.47
YFR056CYFR056C ATG2P53855 1592 aa-0.37□□□□□ -2.47
YFR056CYFR056C NUP170P38181 1502 aa-0.38□□□□□ -2.47
YFR056CYFR056C YOR316C-AQ3E806 69 aa-0.38□□□□□ -2.47
YFR056CYFR056C PEP1P32319 1579 aa-0.4□□□□□ -2.47
YFR056CYFR056C HIR3P47171 1648 aa-0.4□□□□□ -2.47
YFR056CYFR056C FLO1P32768 1537 aa-0.4□□□□□ -2.47
YFR056CYFR056C RKR1Q04781 1562 aa-0.4□□□□□ -2.47
YFR056CYFR056C GCN2P15442 1659 aa-0.42□□□□□ -2.48
YFR056CYFR056C TEL1P38110 2787 aa-0.47□□□□□ -2.48
YFR056CYFR056C YDR034C-AP0C289 58 aa-0.47□□□□□ -2.48
YFR056CYFR056C DYN1P36022 4092 aa-0.5□□□□□ -2.49
YFR056CYFR056C RPL29P05747 59 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
YFR056CYFR056C DDR2P89113 61 aa-0.53□□□□□ -2.49
YFR056CYFR056C YJL133C-AQ3E7A3 74 aa-0.53□□□□□ -2.49
YFR056CYFR056C Q0017Q9ZZX8 53 aa-0.53□□□□□ -2.49
YFR056CYFR056C YBR056W-AI2HB52 66 aa-0.55□□□□□ -2.5
YFR056CYFR056C COX9P07255 59 aa-0.56□□□□□ -2.5
YFR056CYFR056C YLR342W-AQ3E810 57 aa-0.56□□□□□ -2.5
YFR056CYFR056C GCN1P33892 2672 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.5
YFR056CYFR056C YML054C-AQ3E809 52 aa-0.61□□□□□ -2.51
YFR056CYFR056C YHR073W-AP0C5N7 58 aa-0.65□□□□□ -2.51
YFR056CYFR056C CSF1Q12150 2958 aa-0.71□□□□□ -2.52
YFR056CYFR056C TRA1P38811 3744 aa-0.75□□□□□ -2.53
YFR056CYFR056C YJL127C-BQ3E828 52 aa-0.75□□□□□ -2.53
YFR056CYFR056C MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
YFR056CYFR056C IRA1P18963 3092 aa-0.78□□□□□ -2.53
YFR056CYFR056C CUP1-1P0CX80 61 aa-0.78□□□□□ -2.53
YFR056CYFR056C CUP1-2P0CX81 61 aa-0.78□□□□□ -2.53
YFR056CYFR056C SMX2P40204 77 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
YFR056CYFR056C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
YFR056CYFR056C NUM1Q00402 2748 aa-0.89□□□□□ -2.55
YFR056CYFR056C MLP2P40457 1679 aa-0.91□□□□□ -2.55
YFR056CYFR056C YMR105W-AQ8TGS8 64 aa-0.94□□□□□ -2.56
YFR056CYFR056C PMP3P87284 55 aa-0.95□□□□□ -2.56
YFR056CYFR056C IRA2P19158 3079 aa-1□□□□□ -2.57
YFR056CYFR056C TOM7P53507 60 aa-1.01□□□□□ -2.57
YFR056CYFR056C HOR7Q05827 59 aa-1.03□□□□□ -2.57
YFR056CYFR056C VPS13Q07878 3144 aa-1.04□□□□□ -2.58
YFR056CYFR056C YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa-1.22□□□□□ -2.6
YFR056CYFR056C NCE101Q02820 53 aa-1.37□□□□□ -2.63
YFR056CYFR056C TOM1Q03280 3268 aa-1.69□□□□□ -2.68
YFR056CYFR056C RPL39P04650 51 aa-1.79□□□□□ -2.7
YFR056CYFR056C YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa-2.17□□□□□ -2.76
YFR056CYFR056C Q0297Q9ZZV8 51 aa-2.24□□□□□ -2.77
YFR056CYFR056C YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa-3.38□□□□□ -2.95
Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 40.8 ms