RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	SCD5	Q86SK9	330 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	PRR7	Q8TB68	274 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	FGF14	Q92915	247 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	CPXM1	Q96SM3	734 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	SYT11	Q9BT88	431 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	MIS12	Q9H081	205 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	IL37	Q9NZH6	218 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634		A0A1W2PQH9	124 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM92A	A1XBS5	289 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	MED7	O43513	233 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	TBX18	O95935	607 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ERBB2	P04626	1255 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	LAMP2	P13473	410 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	FCAR	P24071	287 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	KRT9	P35527	623 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	VIPR2	P41587	438 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	CDR2	Q01850	454 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ASIC2	Q16515	512 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	NAA35	Q5VZE5	725 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	PARM1	Q6UWI2	310 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	KXD1	Q9BQD3	176 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	CDH7	Q9ULB5	785 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	USP3	Q9Y6I4	520 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634		A0A1W2PQJ5	194 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634		E7ENQ6	273 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	MDM4	O15151	490 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	TPM3	P06753	285 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	NOMO3	P69849	1222 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ZXDB	P98169	803 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	DSG2	Q14126	1118 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	STIL	Q15468	1287 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	TAF5	Q15542	800 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	RNF38	Q9H0F5	515 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	COL4A3	Q01955	1670 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF197	O14709	1029 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ADCY5	O95622	1261 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ZBED1	O96006	694 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	FER	P16591	822 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	CDC25C	P30307	473 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	SOX11	P35716	441 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC8A3	P57103	927 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	BPIFB4	P59827	614 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	ZBED6	P86452	979 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	EDEM1	Q92611	657 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SCARB2-222	ENST00000640634	GCNA	Q96QF7	691 aa		11.49	□□□□□ -0.57

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