RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636188.1

AMT-231, Transcript of aminomethyltransferase, human

TSL 5

Gene AMT, Length 804 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AMT-231	ENST00000636188	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	BEND5	Q7L4P6	421 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	ARC	Q7LC44	396 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	DEFB123	Q8N688	67 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	GPR152	Q8TDT2	470 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	CORO1B	Q9BR76	489 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	THAP2	Q9H0W7	228 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	NENF	Q9UMX5	172 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	16.03	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	OBSL1	O75147	1896 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	FAM92A	A1XBS5	289 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	DAB1	O75553	588 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	ABL1	P00519	1130 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	PFKL	P17858	780 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	SDC4	P31431	198 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	GBP1	P32455	592 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	TUB	P50607	506 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	TAF10	Q12962	218 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	NUP85	Q9BW27	656 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		16.02	■□□□□ 0.16
AMT-231	ENST00000636188	SOBP	A7XYQ1	873 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	MYO1F	O00160	1098 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	PJA2	O43164	708 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	RFPL2	O75678	378 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	CYP1A2	P05177	515 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	MYL4	P12829	197 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	GABRR2	P28476	465 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	MTHFR	P42898	656 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	ADAM15	Q13444	863 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	MCEE	Q96PE7	176 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	IL37	Q9NZH6	218 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	GMIP	Q9P107	970 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		16.01	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	ZNF263	O14978	683 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	RNF8	O76064	485 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	NCAM1	P13591	858 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	GPD1	P21695	349 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	NOS2	P35228	1153 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	ARHGAP25	P42331	645 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	PTP4A2	Q12974	167 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	MTA1	Q13330	715 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	MTMR3	Q13615	1198 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	KCNC3	Q14003	757 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	ACAP1	Q15027	740 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	HECTD3	Q5T447	861 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	MYLIP	Q8WY64	445 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	FAM50B	Q9Y247	325 aa		16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		15.99	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	FAM170A	A1A519	330 aa		15.99	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		15.99	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188		E7ENQ6	273 aa		15.99	■□□□□ 0.15
AMT-231	ENST00000636188	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.2 ms