RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613214.4

TNXB-209, Transcript of tenascin XB, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNXB, Length 6,842 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXB-209ENST00000613214 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 ITGAXP20702 1163 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 KLRC1P26715 233 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 CCDC149Q6ZUS6 474 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 MAGEA9P43362 315 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 UNC45BQ8IWX7 931 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 NEO1Q92859 1461 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 KLHL41O60662 606 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 DDNO94850 711 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 THP07101 528 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 ADRA2BP18089 450 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 C16orf72Q14CZ0 275 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 SLC18A3Q16572 532 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 FIG4Q92562 907 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 USP6NLQ92738 828 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 A0A087WZ62 844 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 C16orf96A6NNT2 1141 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 NDUFS2O75306 463 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 SLC25A27O95847 323 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 CTSEP14091 401 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 CDC42EP1Q00587 391 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 SLFN11Q7Z7L1 901 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 SEPHS2Q99611 448 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 KLHL20Q9Y2M5 609 aa15.94■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 DPP10Q8N608 796 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 STRA8Q7Z7C7 330 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 PRKAG1P54619 331 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 WDR35Q9P2L0 1181 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 TMCC3Q9ULS5 477 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 DSG4Q86SJ6 1040 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 JAMLQ86YT9 394 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 TMEM121Q9BTD3 319 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 RSAD1Q9HA92 442 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 SNX12Q9UMY4 172 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 SIK3Q9Y2K2 1263 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 ARP10275 920 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 BEX3Q00994 111 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 CUL2Q13617 745 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 CATSPER2Q96P56 530 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 OLFM3Q96PB7 478 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 ABCG8Q9H221 673 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 SYBUQ9NX95 663 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 SNX13Q9Y5W8 968 aa15.93■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 MEI4A8MW99 385 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 JCHAINP01591 159 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 MDH1P40925 334 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 ZSWIM7Q19AV6 140 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 AGAP9Q5VTM2 703 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 RBBP4Q09028 425 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 BARGINQ6ZT62 677 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 SAPCD2Q86UD0 394 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 IZUMO1Q8IYV9 350 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 RBBP8Q99708 897 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 SH3GL3Q99963 347 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 ADI1Q9BV57 179 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 FAM86B2P0C5J1 330 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 SERPINB9P50453 376 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 PRKAG3Q9UGI9 489 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 AP3B1O00203 1094 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 KRT33AO76009 404 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 CXCL8P10145 99 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 STILQ15468 1287 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 OLFM1Q99784 485 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 GRID1Q9ULK0 1009 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 SPATA2Q9UM82 520 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 TMEM150BA6NC51 233 aa15.92■□□□□ 0.14
TNXB-209ENST00000613214 LRRC8DQ7L1W4 858 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms