RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589104.5

KDM4B-208, Transcript of lysine demethylase 4B, human

TSL 2

Gene KDM4B, Length 3,470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4B-208	ENST00000589104	TPSAB1	Q15661	275 aa		13.98	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.98	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.98	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		13.98	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		13.98	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		13.98	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	LIG4	P49917	911 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC34A1	Q06495	639 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	TAF5	Q15542	800 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	LRRC6	Q86X45	466 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	TWNK	Q96RR1	684 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	TRIM4	Q9C037	500 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	PTPRD	P23468	1912 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	TM7SF2	O76062	418 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	ARRB2	P32121	409 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	PHB	P35232	272 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	VHL	P40337	213 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	MTMR2	Q13614	643 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	TBCC	Q15814	346 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	PANX3	Q96QZ0	392 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	13.97	□□□□□ -0.17	9e-7	■■■■■ 96.9
KDM4B-208	ENST00000589104		A0A088AWK7	358 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	GCAT	O75600	419 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	TOMM70	O94826	608 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	MBLAC2	Q68D91	279 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	MDM4	O15151	490 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	OGT	O15294	1046 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	CA4	P22748	312 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	CYTH2	Q99418	400 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	NPHS2	Q9NP85	383 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KDM4B-208	ENST00000589104	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	TGM2	P21980	687 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	SCNN1A	P37088	669 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	CXCL9	Q07325	125 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	WASHC5	Q12768	1159 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	SETDB1	Q15047	1291 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	LLGL1	Q15334	1064 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	SORT1	Q99523	831 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	DGKI	O75912	1065 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	ELK3	P41970	407 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	PSMC4	P43686	418 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	SERPINB4	P48594	390 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	EFNA5	P52803	228 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	FAAP100	Q0VG06	881 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	SURF1	Q15526	300 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	RAB6C	Q53S08	254 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	CNMD	O75829	334 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	SERPINB3	P29508	390 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	MIP	P30301	263 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	TAF11	Q15544	211 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	TTC7B	Q86TV6	843 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KDM4B-208	ENST00000589104	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.95	□□□□□ -0.18

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