RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 SLC24A2Q9UI40 661 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.02■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 PIK3CDO00329 1044 aa22.02■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 SLC2A3P11169 496 aa22.02■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.02■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 ATP9AO75110 1047 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 CNTFP26441 200 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 CACNA2D1P54289 1103 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 TERB1Q8NA31 727 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 SOX13Q9UN79 622 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF839A8K0R7 811 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 E9PBE3 544 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL41O60662 606 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 CPT1AP50416 773 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 TMC2Q8TDI7 906 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 CATSPER2Q96P56 530 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 GRK2P25098 689 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 PRIM2P49643 509 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 RIN3Q8TB24 985 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 OPTNQ96CV9 577 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 MTERF3Q96E29 417 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 MLNP12872 115 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 PTPN4P29074 926 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 ALDH1A3P47895 512 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 MCL1Q07820 350 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 IMPAD1Q9NX62 359 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 NCALDP61601 193 aa22.01■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 C17orf102A2RUQ5 167 aa22■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 PTENP60484 403 aa22■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 RIPK2O43353 540 aa22■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 ACER1Q8TDN7 264 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 VPS26AO75436 327 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 BMPR2Q13873 1038 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 CYP51A1Q16850 503 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 STAG3L1P0CL83 205 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 IZUMO2Q6UXV1 221 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 CD302Q8IX05 232 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 KAT2BQ92831 832 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 PTPRMP28827 1452 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 HACL1Q9UJ83 578 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD27Q96NW4 1050 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 TSC22D2O75157 780 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 SLC11A2P49281 568 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 WDR49Q8IV35 697 aa21.98■■□□□ 1.11
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