RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RSPRY1Q96DX4 576 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IQCDQ96DY2 449 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NOX5Q96PH1 765 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC22A12Q96S37 553 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CYP2S1Q96SQ9 504 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NUP58Q9BVL2 599 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ULBP1Q9BZM6 244 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EDEM3Q9BZQ6 932 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TTYH3Q9C0H2 523 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CLIC5Q9NZA1 410 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NAGPAQ9UK23 515 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CEP83Q9Y592 693 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TECTAO75443 2155 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1W2PQH9 124 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COCHO43405 550 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TLR5O60602 858 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LSM8O95777 96 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC172P0C7W6 258 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LCP1P13796 627 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FERP16591 822 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PGFP49763 221 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DAOAP59103 153 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CDR2Q01850 454 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KLHDC10Q6PID8 442 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BHLHA9Q7RTU4 235 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCD5Q86SK9 330 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PASD1Q8IV76 773 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IRGQQ8WZA9 623 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BAP1Q92560 729 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EDAQ92838 391 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNF38Q9H0F5 515 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PDCL3Q9H2J4 239 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCSER2Q9H7U1 834 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NMUR1Q9HB89 426 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ST7Q9NRC1 585 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OSER1Q9NX31 292 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CYTH4Q9UIA0 394 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCL26Q9Y258 94 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ITIH6Q6UXX5 1313 aa13.54□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1W2PQJ5 194 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LRRC53A6NM62 1247 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SART1O43290 800 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NARSO43776 548 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GABBR2O75899 941 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RALAP11233 206 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RARGP13631 454 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SNX16P57768 344 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PFKPQ01813 784 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 USP4Q13107 963 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF77Q15935 545 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SARM1Q6SZW1 724 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM110Q86TL2 294 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 YAF2Q8IY57 180 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WDTC1Q8N5D0 677 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIAA1958Q8N8K9 716 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM35BQ8NCS4 154 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BPIFB1Q8TDL5 484 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NACA2Q9H009 215 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMOC2Q9H3U7 446 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EPHX3Q9H6B9 360 aa13.53□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 YJEFN3A6XGL0 299 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 E5RJQ4 531 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 E7ENQ6 273 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PIK3R2O00459 728 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CHADO15335 359 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MMEP08473 750 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLCB2Q00722 1185 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARID5AQ03989 594 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SIGLEC14Q08ET2 396 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GRM2Q14416 872 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TAF3Q5VWG9 929 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BTBD8Q5XKL5 378 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRIM72Q6ZMU5 477 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GPIHBP1Q8IV16 184 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SH3RF2Q8TEC5 729 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC20A1Q8WUM9 679 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GOLGA1Q92805 767 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DNASE1L2Q92874 299 aa13.52□□□□□ -0.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IRF7Q92985 503 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms