RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 BPIFB4P59827 614 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 KAT5Q92993 513 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 TATDN2Q93075 761 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 ISCUQ9H1K1 167 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CDT1Q9H211 546 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 HYOU1Q9Y4L1 999 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 PTPRJQ12913 1337 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 IGF2RP11717 2491 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CITO14578 2027 aa21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A1B0GUA9 196 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD62A6NC57 917 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 ENC1O14682 589 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 LRG1P02750 347 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 RAP1GAPP47736 663 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 GALCP54803 685 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 HADHBP55084 474 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 BIRC3Q13489 604 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 PLA2G2CQ5R387 149 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF677Q86XU0 584 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 SMARCD2Q92925 531 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 TCEAL4Q96EI5 215 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CORO1BQ9BR76 489 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 WASF3Q9UPY6 502 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 BACE2Q9Y5Z0 518 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 WDR27A2RRH5 827 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 RTN2O75298 545 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 THP07101 528 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CTAGE8P0CG41 777 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 TNFSF9P41273 254 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 ELF2Q15723 593 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 MFSD6LQ8IWD5 586 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF14Q9UBS8 474 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 ARNTLO00327 626 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CES2O00748 559 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 PTGESO14684 152 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP26A1O43174 497 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 B4GALT5O43286 388 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 BUB1O43683 1085 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CLTAP09496 248 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CHRNB2P17787 502 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CDR2Q01850 454 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF43Q68DV7 783 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 Q6ZS52 159 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 GAB3Q8WWW8 586 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 RFFLQ8WZ73 363 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 TLR10Q9BXR5 811 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 TRPV4Q9HBA0 871 aa21.09■□□□□ 0.97
CTDSP2-204ENST00000548823 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 PALMO75781 387 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP11B1P15538 503 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 ELF1P32519 619 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 VIPR2P41587 438 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 PDE6CP51160 858 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 RING1Q06587 406 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 FOXC1Q12948 553 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 CUL2Q13617 745 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 NCOA4Q13772 614 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 SYCE1Q8N0S2 351 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.08■□□□□ 0.96
CTDSP2-204ENST00000548823 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms