RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 SLC8A1P32418 973 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PLA2G4AP47712 749 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PTK7Q13308 1070 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 C6orf10Q5SRN2 563 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FAM162AQ96A26 154 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CDYLQ9Y232 598 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ACKR2O00590 384 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 HPGDP15428 266 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PON1P27169 355 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PTPN7P35236 360 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 HALP42357 657 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CNTN1Q12860 1018 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ITGA7Q13683 1181 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 C11orf74Q86VG3 221 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MED8Q96G25 268 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ING2Q9H160 280 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 YY1AP1Q9H869 796 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RIC8BQ9NVN3 520 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RAMP2O60895 175 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 HAUS5O94927 633 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CTDNEP1O95476 244 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TGM2P21980 687 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TUBP50607 506 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 KIF2CQ99661 725 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TSPAN16Q9UKR8 245 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FAM86B1E9PN63 330 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 USP17L7P0C7H9 530 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ITIH2P19823 946 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 NCKAP1LP55160 1127 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC14Q15048 493 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 KCNT1Q5JUK3 1230 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 COG1Q8WTW3 980 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 APBB2Q92870 758 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 KCTD10Q9H3F6 313 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PQJ5 194 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 KRT87PA6NCN2 255 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MYO1GB0I1T2 1018 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ATP8B1O43520 1251 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MAP3K6O95382 1288 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GLUD1P00367 558 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FAXCQ5TGI0 409 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TRABDQ9H4I3 376 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CASZ1Q86V15 1759 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SPATA31D3P0C874 917 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 C2CD6Q53TS8 623 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 USP49Q70CQ1 688 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF614Q8N883 585 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SOHLH2Q9NX45 425 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 USP18Q9UMW8 372 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RPTORQ8N122 1335 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1B0GTH6 734 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SELPP16109 830 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 KRT4P19013 534 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 HLA-DPA1P20036 260 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GPC1P35052 558 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PSMD5Q16401 504 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 VPS37AQ8NEZ2 397 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SLC2A14Q8TDB8 520 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 THAP2Q9H0W7 228 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RWDD3Q9Y3V2 267 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FGF19O95750 216 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 INHAP05111 366 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 RBP3P10745 1247 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CYP11B1P15538 503 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 BCL2L1Q07817 233 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms