RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	AVIL	O75366	819 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GCAT	O75600	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SPAG6	O75602	509 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RAD17	O75943	681 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	UPP2	O95045	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	BGN	P21810	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	VHL	P40337	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MMRN1	Q13201	1228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GSTA3	Q16772	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	WDR44	Q5JSH3	913 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TTC13	Q8NBP0	860 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CENPF	P49454	3210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FCHO1	O14526	889 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	OGT	O15294	1046 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ARIH2	O95376	493 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KRT7	P08729	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PYGB	P11216	843 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CD1E	P15812	388 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TPSB2	P20231	275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RAB27A	P51159	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CCNI	Q14094	377 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TAF11	Q15544	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PDLIM1	O00151	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	IRF6	O14896	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MDM4	O15151	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MICAL2	O94851	1124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	BPGM	P07738	259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ADORA2A	P29274	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	HSPA1L	P34931	641 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SATB1	Q01826	763 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PTK7	Q13308	1070 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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