RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 RCCD1A6NED2 376 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 HSF2BPO75031 334 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 FGF19O95750 216 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 LTFP02788 710 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 PSEN1P49768 467 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 TCEAL1Q15170 157 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 DCUN1D2Q6PH85 259 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 ARCQ7LC44 396 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 NUP85Q9BW27 656 aa21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 E7ENQ6 273 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 LINC01565O15544 149 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 PAPLNO95428 1278 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 GLP2RO95838 553 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 ANKRD54Q6NXT1 300 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 LEMD2Q8NC56 503 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 CORO1BQ9BR76 489 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 LACRTQ9GZZ8 138 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 PIDD1Q9HB75 910 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 ASAH2Q9NR71 780 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 GMIPQ9P107 970 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 TFR2Q9UP52 801 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 Q7L0L9 218 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 BEND5Q7L4P6 421 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 DEFB123Q8N688 67 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 MYLIPQ8WY64 445 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 MCEEQ96PE7 176 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 GCNAQ96QF7 691 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 LAMA3Q16787 3333 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 DENND4CQ5VZ89 1909 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 A0A1W2PQH9 124 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 CAPN9O14815 690 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 DAB1O75553 588 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 GRAP2O75791 330 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 MTA2O94776 668 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 F11P03951 625 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 RALAP11233 206 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 CDC25CP30307 473 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 TAF5Q15542 800 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 SCD5Q86SK9 330 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 TMC8Q8IU68 726 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 LRRC3Q9BY71 257 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 KCND1Q9NSA2 647 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 CLDND1Q9NY35 253 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 TRANK1O15050 2925 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-215ENST00000532308 A0A0U1RQJ8 604 aa21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-215ENST00000532308 TMEM191CA6NGB0 347 aa21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-215ENST00000532308 GJB6O95452 261 aa21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-215ENST00000532308 ABL1P00519 1130 aa21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-215ENST00000532308 MYL4P12829 197 aa21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms