RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356		A0A1B0GTW7	788 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TISP43	B9A030	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356		B9A039	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	AREL1	O15033	823 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	NDUFS2	O75306	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PDC	P20941	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	HTR1B	P28222	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CACNB3	P54284	484 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF174	Q15697	407 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ITGA10	O75578	1167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TBX18	O95935	607 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TSHR	P16473	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	LSP1	P33241	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	MAPK10	P53779	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	POSTN	Q15063	836 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TAF11	Q15544	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	LNX2	Q8N448	690 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PHKB	Q93100	1093 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	HFM1	A2PYH4	1435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	USP32	Q8NFA0	1604 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356		B4E171	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TOR1B	O14657	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	MGEA5	O60502	916 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	POLB	P06746	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CNTF	P26441	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TSPAN7	P41732	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TEC	P42680	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	LIFR	P42702	1097 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	MGAT5	Q09328	741 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TAF5	Q15542	800 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	COA7	Q96BR5	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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