RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518963.5

PSD3-208, Transcript of pleckstrin and Sec7 domain containing 3, human

TSL 2

Gene PSD3, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSD3-208	ENST00000518963	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	AP4M1	O00189	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	EXOC5	O00471	708 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	FOXN1	O15353	648 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SPRY2	O43597	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	TCEA3	O75764	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	EPHA3	P29320	983 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	CHKA	P35790	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	GRIA3	P42263	894 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	TAP1	Q03518	808 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	GPS1	Q13098	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PRR25	Q96S07	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	TRIM38	O00635	465 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PCDH17	O14917	1159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	DHH	O43323	396 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ASNA1	O43681	348 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	USP1	O94782	785 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ENG	P17813	658 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	RBL1	P28749	1068 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	CYP2C18	P33260	490 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	AVPR1B	P47901	424 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PDE1A	P54750	535 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	E2F1	Q01094	437 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	MTAP	Q13126	283 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	GRM1	Q13255	1194 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ZACN	Q401N2	412 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	WDR24	Q96S15	920 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	COL15A1	P39059	1388 aa		4.53	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963		H0YIZ8	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	ACKR2	O00590	384 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	PMPCB	O75439	489 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	PDE8B	O95263	885 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	GC	P02774	474 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	SLC5A2	P31639	672 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	MCM5	P33992	734 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	PBX1	P40424	430 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	PSG6	Q00889	435 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	COL10A1	Q03692	680 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	ICA1	Q05084	483 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	FHL2	Q14192	279 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	GRM4	Q14833	912 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963		Q6ZWC4	215 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PSD3-208	ENST00000518963	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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