RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515484.2

GPBP1-209, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, human

TSL 2

Gene GPBP1, Length 962 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPBP1-209	ENST00000515484	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	VPS16	Q9H269	839 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484		F8W8V4	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	GOLIM4	O00461	696 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	CES2	O00748	559 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	HTR7	P34969	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	CPT1A	P50416	773 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484		A8MVJ9	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	RASAL1	O95294	804 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	RHCE	P18577	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	NR4A2	P43354	598 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	COPA	P53621	1224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	RHD	Q02161	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	CFHR1	Q03591	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	MAPK7	Q13164	816 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	COL15A1	P39059	1388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GPBP1-209	ENST00000515484		A0A087WZ62	844 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	PSMD9	O00233	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	EXOC5	O00471	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	PIAS2	O75928	621 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	PEX2	P28328	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	PGD	P52209	483 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	FAM193A	P78312	1265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	RAB27B	O00194	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	MARCH6	O60337	910 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	RASSF9	O75901	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	MT-ND5	P03915	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	CREB1	P16220	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	IL1R2	P27930	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	NTSR1	P30989	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	GATM	P50440	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	ITGA8	P53708	1063 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	CFHR3	Q02985	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPBP1-209	ENST00000515484	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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