RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504849.5

RFC1-208, Transcript of replication factor C subunit 1, human

TSL 3

Gene RFC1, Length 873 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFC1-208	ENST00000504849	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	ESX1	Q8N693	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	USP6	P35125	1406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849		H3BUI4	141 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	SLC27A2	O14975	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	NRP2	O60462	931 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	LARGE1	O95461	756 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	PEX11B	O96011	259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	FGFR2	P21802	821 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	ITGA8	P53708	1063 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TUBB4B	P68371	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TLE2	Q04725	743 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	PPARA	Q07869	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	REST	Q13127	1097 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	MTX1	Q13505	466 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	KAT5	Q92993	513 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	MYOT	Q9UBF9	498 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	AGL	P35573	1532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	PTPRU	Q92729	1446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	LRRC37A3	O60309	1634 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849		F8W8V4	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	CDC14B	O60729	498 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	SMC2	O95347	1197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	IVL	P07476	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TYR	P14679	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	AOAH	P28039	575 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	RAD52	P43351	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RFC1-208	ENST00000504849	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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