RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 ZXDBP98169 803 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CYP27A1Q02318 531 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 KCNC4Q03721 635 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CAMK2BQ13554 666 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 KCNK18Q7Z418 384 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 DNASE2BQ8WZ79 361 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 MYLPFQ96A32 169 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SYT15Q9BQS2 421 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 RNF38Q9H0F5 515 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 PARVGQ9HBI0 331 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CDH9Q9ULB4 789 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 RAD54BQ9Y620 910 aa6.56□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 A0A1B0GVT2 93 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 F8VP50 259 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 GFRA2O00451 464 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TRAK2O60296 914 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 OLFM2O95897 454 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 IRF1P10914 325 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CDK4P11802 303 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 OXTRP30559 389 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SLC12A3P55017 1021 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 USP46P62068 366 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CXADRP78310 365 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TAF10Q12962 218 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 MYO1EQ12965 1108 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 POSTNQ15063 836 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 E2F5Q15329 346 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ME3Q16798 604 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CCDC142Q17RM4 750 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 BROXQ5VW32 411 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 MIB1Q86YT6 1006 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 KCNN1Q92952 543 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 FBXO32Q969P5 355 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ACOX2Q99424 681 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 PLIN2Q99541 437 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 PKMYT1Q99640 499 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 GABRG3Q99928 467 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 BBS2Q9BXC9 721 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CD93Q9NPY3 652 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 67.3
CBX1-205ENST00000495350 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.55□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 METTL12A8MUP2 240 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TYRP14679 529 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 PLCG1P19174 1290 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 YWHAQP27348 245 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ACTN2P35609 894 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 PRPHP41219 470 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 DGKGP49619 791 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 TPMTP51580 245 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 RBP5P82980 135 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 RHDQ02161 417 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 CCDC173Q0VFZ6 552 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 ORC1Q13415 861 aa6.54□□□□□ -1.36
CBX1-205ENST00000495350 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms