RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 CNGA3Q16281 694 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 FXNQ16595 210 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC153Q494R4 210 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 UNC93AQ86WB7 457 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 LPPQ93052 612 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CAVIN3Q969G5 261 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFP42Q96MM3 310 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CATSPER2Q96P56 530 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SDCBP2Q9H190 292 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 WNT8AQ9H1J5 351 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SMYD3Q9H7B4 428 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CARD8Q9Y2G2 431 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD62A6NC57 917 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 KPNA7A9QM74 516 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ENPP3O14638 875 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFB5O43674 189 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 WEE2P0C1S8 567 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GBP1P32455 592 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SCNN1GP51170 649 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SEC24CP53992 1094 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TUSC3Q13454 348 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRC26Q2I0M4 334 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 FBF1Q8TES7 1133 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 IFT81Q8WYA0 676 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 HAPLN3Q96S86 360 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 INIPQ9NRY2 104 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MIOSQ9NXC5 875 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PDP2Q9P2J9 529 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TET1Q8NFU7 2136 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MYH10P35580 1976 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 RCCD1A6NED2 376 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PODXLO00592 558 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PPEF2O14830 753 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 THAP12O43422 761 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAPPC3O43617 180 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 EFCAB14O75071 495 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ALDH2P05091 517 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PFKMP08237 780 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MYBL1P10243 752 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CD58P19256 250 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 FUT4P22083 530 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 S100A1P23297 94 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFRSF8P28908 595 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SERPINB8P50452 374 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 RAD23BP54727 409 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 LILRA4P59901 499 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP11AP98196 1134 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CFAP58Q5T655 872 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF220Q5VTB9 566 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ACAD10Q6JQN1 1059 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 KLC3Q6P597 504 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM86AQ8N2M4 240 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GBP5Q96PP8 586 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PCDHB18PQ96TA0 734 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF19AQ9NV58 838 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms