RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 ABCB6Q9NP58 842 aa6.86□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 HPS4Q9NQG7 708 aa6.86□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.86□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.86□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.86□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 HCRTO43612 131 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 PHACTR2O75167 634 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 TACC1O75410 805 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 PRAMEF12O95522 483 aa6.85□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 CSH1P0DML2 217 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 CSH2P0DML3 217 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 ATICP31939 592 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 CASP4P49662 377 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 GALK1P51570 392 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 AP3M2P53677 418 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 EMP3P54852 163 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 MYL6P60660 151 aa6.85□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 TNNC1P63316 161 aa6.85□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 DMC1Q14565 340 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 TAF12Q16514 161 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 NFIL3Q16649 462 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.85□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 CEP135Q66GS9 1140 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 YAF2Q8IY57 180 aa6.85□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 DEFB119Q8N690 84 aa6.85□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 E2F7Q96AV8 911 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 MSANTD3Q96H12 275 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 SYT15Q9BQS2 421 aa6.85□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.85□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 DKK4Q9UBT3 224 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 CDH9Q9ULB4 789 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.85□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 MYLKQ15746 1914 aa6.85□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 FAM149AA5PLN7 773 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 DPYSL4O14531 572 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 MAPK13O15264 365 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 ATP2C2O75185 946 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 GJB3O75712 270 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 APBB3O95704 486 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 ITPKAP23677 461 aa6.84□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 CYP2F1P24903 491 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 LMO2P25791 158 aa6.84□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 WEE1P30291 646 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 MAGEA11P43364 429 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR15P49685 360 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 DLG4P78352 724 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 CYP4F8P98187 520 aa6.84□□□□□ -1.31
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CTDSPL-208ENST00000486978 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 PNOCQ13519 176 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 NCOA4Q13772 614 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC142Q17RM4 750 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF699Q32M78 642 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR158Q5T848 1215 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.84□□□□□ -1.31
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