RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 LRCH2Q5VUJ6 765 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF425Q6IV72 752 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM65Q6PI78 240 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 UNC13DQ70J99 1090 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 GALNT16Q8N428 558 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 PRDM11Q9NQV5 511 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 COL20A1Q9P218 1284 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.06□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 M0R3H8 397 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TMPRSS11DO60235 418 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 SNX2O60749 519 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 HRGP04196 525 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 DIO1P49895 249 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TIRAPP58753 221 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 LMAN2Q12907 356 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 GBX1Q14549 363 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 NPY5RQ15761 445 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 C14orf80Q86SX3 495 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 GLCCI1Q86VQ1 547 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 SESTD1Q86VW0 696 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM118BQ9BPY3 351 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 CHST8Q9H2A9 424 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM83DQ9H4H8 585 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF212Q9UDV6 495 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 SNX13Q9Y5W8 968 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 BTBD19C9JJ37 291 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 DSCR3O14972 297 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ADAMTS3O15072 1205 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 MT-CO3P00414 261 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 IL1R1P14778 569 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 CD19P15391 556 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 YY1P25490 414 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 IL1R2P27930 398 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 PTGER1P34995 402 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 PLCD1P51178 756 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 31.1
RABGGTB-210ENST00000485459 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 C4orf46Q504U0 113 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TTC8Q8TAM2 541 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ASIC5Q9NY37 505 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 OBP2AQ9NY56 170 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF521Q96K83 1311 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 CECR2Q9BXF3 1484 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TP73O15350 636 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 SPRY2O43597 315 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 RHCEP18577 417 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 RHDQ02161 417 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNAB1Q14722 419 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 MZT2AQ6P582 158 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF44Q7L0R7 432 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 VPS50Q96JG6 964 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 SNX22Q96L94 193 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 APOL5Q9BWW9 433 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-210ENST00000485459 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 NTSR1P30989 418 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNB1Q14721 858 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 ST3GAL2Q16842 350 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 AWAT1Q58HT5 328 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM63BQ5T3F8 832 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 PLAG1Q6DJT9 500 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 VSTM1Q6UX27 236 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 CLEC9AQ6UXN8 241 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 CUL5Q93034 780 aa5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms