RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MROH8Q9H579 483 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP4K3Q8IVH8 894 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DACH2Q96NX9 599 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASTN1O14525 1302 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP9AO75110 1047 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPH1P17752 444 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBCCQ15814 346 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf131Q5VYM1 1079 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MKL1Q969V6 931 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa17.15■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RHOBTB1O94844 696 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CES3Q6UWW8 571 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEP19Q96LK0 163 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADRB2P07550 413 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITGB5P18084 799 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP2F1P24903 491 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FDFT1P37268 417 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STRA8Q7Z7C7 330 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OPTNQ96CV9 577 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDH9Q9HC56 1237 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNH4Q9UQ05 1017 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP6V1B1P15313 513 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TKTL1P51854 596 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRADDQ15628 312 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM83EQ2M2I3 478 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLIT2O94813 1529 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPTLC1O15269 473 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRIN3BO60391 1043 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANXA9O76027 345 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NME5P56597 212 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAB2P98082 770 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJB3Q8WWF6 145 aa17.14■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 E9PBE3 544 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPAN3O60637 253 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLHL41O60662 606 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO1DO94832 1006 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYBBP04839 570 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FLOT2Q14254 428 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRUNE1Q86TP1 453 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLEC4FQ8N1N0 589 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 REPS2Q8NFH8 660 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NINJ2Q9NZG7 142 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMCC1O94876 653 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TGFB3P10600 412 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AMPD1P23109 780 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OCA2Q04671 838 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C16orf87Q6PH81 154 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C4orf22Q6V702 233 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLEKHH3Q7Z736 793 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNERQ8NFT8 737 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCP10LQ8TDR4 215 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP10A1A4S6 786 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STX7O15400 261 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLRA3O75311 464 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPTP10636 758 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIPP30301 263 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HARS2P49590 506 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INPP5AQ14642 412 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BRSK2Q8IWQ3 736 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KDM3BQ7LBC6 1761 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADM5C9JUS6 153 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP2K7O14733 419 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP12O75317 370 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POMCP01189 267 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERPIND1P05546 499 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PYGLP06737 847 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 THP07101 528 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ODC1P11926 461 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC26A2P50443 739 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INPP5DQ92835 1189 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC40Q9H9A6 602 aa17.13■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LACTBL1A8MY62 500 aa17.12■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KBTBD13C9JR72 458 aa17.12■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms