RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474961.5

DDX39B-217, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 974 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-217ENST00000474961 TXLNBQ8N3L3 684 aa10.01□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 MIS12Q9H081 205 aa10.01□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 PNPLA8Q9NP80 782 aa10.01□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 HSFX1Q9UBD0 423 aa10.01□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 STRIP2Q9ULQ0 834 aa10.01□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 DOCK6Q96HP0 2047 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 DENND4CQ5VZ89 1909 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 USP27XA6NNY8 438 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 GOLGA8SH3BPF8 625 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 PRRG1O14668 218 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 TNFRSF10BO14763 440 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 PER2O15055 1255 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 CCP110O43303 1012 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 GLUD1P00367 558 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 ABL1P00519 1130 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 ARHGAP25P42331 645 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 CLCN4P51793 760 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 TKTL1P51854 596 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 GSCP56915 257 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 KIF5AQ12840 1032 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 LAPTM4AQ15012 233 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 PTPROQ16827 1216 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 RAB41Q5JT25 222 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 ZNF662Q6ZS27 426 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 TCEAL8Q8IYN2 117 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 NUP93Q8N1F7 819 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 KREMEN2Q8NCW0 462 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 STKLD1Q8NE28 680 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 GPR152Q8TDT2 470 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 GIPC2Q8TF65 315 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 SLC22A17Q8WUG5 538 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 SPATA17Q96L03 361 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 ULBP1Q9BZM6 244 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 TSGA10Q9BZW7 698 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 KCND1Q9NSA2 647 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 WDR35Q9P2L0 1181 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 TRIM10Q9UDY6 481 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 FBXW11Q9UKB1 542 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 YIPF1Q9Y548 306 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 DUSP10Q9Y6W6 482 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 NCANO14594 1321 aa10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 SLC38A8A6NNN8 435 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 BTNL10A8MVZ5 291 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 KRT86O43790 486 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 FBXO21O94952 628 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 GJB6O95452 261 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 C1RP00736 705 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 USP17L7P0C7H9 530 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 ATF6P18850 670 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 ALDH1A3P47895 512 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 SLC5A3P53794 718 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 SLC6A3Q01959 620 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 TWF1Q12792 350 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 MAMLD1Q13495 774 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 TCEAL1Q15170 157 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 DUSP6Q16828 381 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 DNAJC24Q6P3W2 148 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 OLFML1Q6UWY5 402 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 ZSCAN30Q86W11 494 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 C3orf20Q8ND61 904 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 SCAMP5Q8TAC9 235 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 SLC7A14Q8TBB6 771 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 CLEC4CQ8WTT0 213 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 RFFLQ8WZ73 363 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 MCRS1Q96EZ8 462 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 NUP85Q9BW27 656 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 TLE6Q9H808 572 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 LZTFL1Q9NQ48 299 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 CNGB3Q9NQW8 809 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 PARVAQ9NVD7 372 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 IL37Q9NZH6 218 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.99□□□□□ -0.81
DDX39B-217ENST00000474961 INSL5Q9Y5Q6 135 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms