RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466539.1

PSME4-204, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 4

Gene PSME4, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-204ENST00000466539 WDR59Q6PJI9 974 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 FAM228AQ86W67 206 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 C7orf31Q8N865 590 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 DNAJB3Q8WWF6 145 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 CCDC51Q96ER9 411 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 MAP6Q96JE9 813 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 MAP7D2Q96T17 732 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 SYT11Q9BT88 431 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 VPS16Q9H269 839 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 SNTG2Q9NY99 539 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 MYO6Q9UM54 1294 aa6.65□□□□□ -1.34
PSME4-204ENST00000466539 PTPRJQ12913 1337 aa6.65□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 SCN1AP35498 2009 aa6.65□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 SCN5AQ14524 2016 aa6.65□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 PTPRSQ13332 1948 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 ZNF233A6NK53 670 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 CLDN3O15551 220 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 PSPNO60542 156 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 EXOC3O60645 756 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 MFAP3LO75121 409 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 TPM3P06753 285 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 NAT2P11245 290 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 PON1P27169 355 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 LIG4P49917 911 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 VAMP7P51809 220 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 GSDMDP57764 484 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 PPP2R2AP63151 447 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 IGBP1P78318 339 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 STRN3Q13033 797 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 SYCP1Q15431 976 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 NAB2Q15742 525 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 KYAT1Q16773 422 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 KIZQ2M2Z5 673 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 DRC7Q8IY82 874 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 METTL13Q8N6R0 699 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 UBR7Q8N806 425 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 USP38Q8NB14 1042 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 NLRP4Q96MN2 994 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 PANX2Q96RD6 677 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 NUP58Q9BVL2 599 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 GPR88Q9GZN0 384 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 ASB7Q9H672 318 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 CHST12Q9NRB3 414 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 NENFQ9UMX5 172 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 TSC2P49815 1807 aa6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 ATP8B3O60423 1300 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 LCA5LO95447 670 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 VNN1O95497 513 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 CXCL10P02778 98 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 CLTAP09496 248 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 CKBP12277 381 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 TNFSF9P41273 254 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 PRKCIP41743 596 aa6.63□□□□□ -1.35
PSME4-204ENST00000466539 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms