RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 UNGP13051 313 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
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USP54-210ENST00000466048 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.97□□□□□ -1.13
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USP54-210ENST00000466048 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.133e-9■■■■■ 206.8
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USP54-210ENST00000466048 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 UCMAQ8WVF2 138 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 RSAD2Q8WXG1 361 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 CCDC138Q96M89 665 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 KATNBL1Q9H079 304 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 PALMDQ9NP74 551 aa7.96□□□□□ -1.14
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