RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 CRACR2AQ9BSW2 395 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 NACA2Q9H009 215 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 ATG2BQ96BY7 2078 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 GFRA3O60609 400 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 PDE4CQ08493 712 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 CETN1Q12798 172 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 CCINQ13939 588 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM196Q5HYL7 178 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 GJB7Q6PEY0 223 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 KREMEN1Q96MU8 473 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 ZSWIM1Q9BR11 485 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 ANTXRLA6NF34 631 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 P4HA2O15460 535 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 CYP17A1P05093 508 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 RARGP13631 454 aa25.18■■□□□ 1.62
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SH3BP5-208ENST00000459627 C1orf228Q6PIY5 440 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 ANKRD52Q8NB46 1076 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 P2RY13Q9BPV8 354 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 PNPLA8Q9NP80 782 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 NAGPAQ9UK23 515 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 FBXO4Q9UKT5 387 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 MYOFQ9NZM1 2061 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 PRR23AA6NEV1 266 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 PROB1E7EW31 1015 aa25.17■■□□□ 1.62
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SH3BP5-208ENST00000459627 NFATC1O95644 943 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 VDRP11473 427 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 GAB4Q2WGN9 574 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 DGKKQ5KSL6 1271 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 GBP4Q96PP9 640 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 USP3Q9Y6I4 520 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 O00370 1275 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 PIK3R2O00459 728 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC9A1P19634 815 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 TUBP50607 506 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 TKTL1P51854 596 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 DMWDQ09019 674 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 DHCR24Q15392 516 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 BBS7Q8IWZ6 715 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 CD101Q93033 1021 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
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SH3BP5-208ENST00000459627 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 TDGF1P13385 188 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 OPRD1P41143 372 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC6A11P48066 632 aa25.15■■□□□ 1.62
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SH3BP5-208ENST00000459627 MESP2Q0VG99 397 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 NR1H3Q13133 447 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 C10orf120Q5SQS8 335 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 RHBDF2Q6PJF5 856 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 SFTPA1Q8IWL2 248 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 SPEM1Q8N4L4 309 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 ULBP1Q9BZM6 244 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 CYLDQ9NQC7 956 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 HESX1Q9UBX0 185 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 RNF40O75150 1001 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 KRT5P13647 590 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 CXCL12P48061 93 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 BST2Q10589 180 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 RAB41Q5JT25 222 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 C12orf40Q86WS4 652 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 MIB1Q86YT6 1006 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5-208ENST00000459627 FANCMQ8IYD8 2048 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 E2F8A0AVK6 867 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 HMBSP08397 361 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 CCR3P51677 355 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 AMPD2Q01433 879 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 GCNT1Q02742 428 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF528Q3MIS6 628 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 LY6G5CQ5SRR4 150 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 ACP6Q9NPH0 428 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 RASAL2Q9UJF2 1139 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 M0QYV0 167 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 GREM1O60565 184 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 GABBR2O75899 941 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP5-208ENST00000459627 PAEPP09466 180 aa25.12■■□□□ 1.61
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