RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CYLDQ9NQC7 956 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 TNFRSF10BO14763 440 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 CA8P35219 290 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 TUBB2AQ13885 445 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 MGAT5BQ3V5L5 792 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 RHOT1Q8IXI2 618 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 SPATA4Q8NEY3 305 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 FNIP1Q8TF40 1166 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 RAPGEF5Q92565 580 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 TUBB2BQ9BVA1 445 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 MTRRQ9UBK8 725 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 SDC4P31431 198 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 MAN1A1P33908 653 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 SNX16P57768 344 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 TBCBQ99426 244 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 RAD9AQ99638 391 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 CNPY3Q9BT09 278 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 HEMGNQ9BXL5 484 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 CARD9Q9H257 536 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 NUDT5Q9UKK9 219 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 C5orf42Q9H799 3197 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 H7C4K7 107 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 PAFAH1B1P43034 410 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 RASGEF1CQ8N431 466 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 PATJQ8NI35 1801 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 GLUD2P49448 558 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 HDAC4P56524 1084 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 DSG1Q02413 1049 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 ADCY2Q08462 1091 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 ELF2Q15723 593 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 GIPC2Q8TF65 315 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 USP18Q9UMW8 372 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 SEC24AO95486 1093 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 CD48P09326 243 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 SPATA31D3P0C874 917 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 SHHQ15465 462 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 ACTRT1Q8TDG2 376 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 HSPH1Q92598 858 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.098e-6■■■□□ 16.7
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF8O76064 485 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT10P13645 584 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 USP3Q9Y6I4 520 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 GBF1Q92538 1859 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 PSTPIP1O43586 416 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 HSF2BPO75031 334 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 NCAM1P13591 858 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 MATKP42679 507 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 LTFP02788 710 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 RARAP10276 462 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 MFSD7Q6UXD7 560 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 KLHL7Q8IXQ5 586 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT222Q8N1A0 295 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC9A7Q96T83 725 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 NMUR1Q9HB89 426 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 EFCAB8A8MWE9 144 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT1P04264 644 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 ATF6P18850 670 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 SULT1E1P49888 294 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 NME3Q13232 169 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 KAZNQ674X7 775 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms