RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SRGAP2O75044 1071 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADH1AP07327 375 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CXCR5P32302 372 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NOS2P35228 1153 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RGS19P49795 217 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RWDD2BP57060 319 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ERVK-21P61565 698 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HADHQ16836 314 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LRRC38Q5VT99 294 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SDHAF4Q5VUM1 108 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DEFB106AQ8N104 65 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SCAMP5Q8TAC9 235 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 POF1BQ8WVV4 589 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CFAP57Q96MR6 1250 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLC2A13Q96QE2 648 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PSMB7Q99436 277 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TCF25Q9BQ70 676 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CYP4F11Q9HBI6 524 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TLR9Q9NR96 1032 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IL37Q9NZH6 218 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RNF14Q9UBS8 474 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MSRAQ9UJ68 235 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SCML2Q9UQR0 700 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CAPN9O14815 690 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SOAT2O75908 522 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ARHGEF15O94989 841 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SEC24AO95486 1093 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CNPP09543 421 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BMP8BP34820 402 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PCK1P35558 622 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PEX5P50542 639 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TAS2R40P59535 323 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ERVFC1P60507 584 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RAB30Q15771 203 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DCAF6Q58WW2 860 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HFE2Q6ZVN8 426 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BEND5Q7L4P6 421 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BHLHA9Q7RTU4 235 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TCEAL8Q8IYN2 117 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COG1Q8WTW3 980 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRT35Q92764 455 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CARD9Q9H257 536 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RRN3Q9NYV6 651 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EHD2Q9NZN4 543 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MTUS1Q9ULD2 1270 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM92AA1XBS5 289 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLC38A8A6NNN8 435 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRRG1O14668 218 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FSCN2O14926 492 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LRCH4O75427 683 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRT7P08729 469 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATF6P18850 670 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 YWHAQP27348 245 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PAFAH1B1P43034 410 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ALDH1A3P47895 512 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATP11AP98196 1134 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDO1Q16878 200 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC181Q5TID7 509 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLPP4Q5VZY2 271 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BSPRYQ5W0U4 402 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 STRADAQ7RTN6 431 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 POLNQ7Z5Q5 900 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MON1AQ86VX9 555 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM172AQ8WUF8 416 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ALG3Q92685 438 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CAPZA3Q96KX2 299 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KLHL5Q96PQ7 755 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCC13Q9NSE7 274 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CEP290O15078 2479 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C2orf71A6NGG8 1288 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF185O15231 689 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CEP104O60308 925 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FYNP06241 537 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CSH1P0DML2 217 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CSH2P0DML3 217 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NCAM1P13591 858 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DNAJB1P25685 340 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KLRC2P26717 231 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MIPP30301 263 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GJC1P36383 396 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MARCKSL1P49006 195 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms