RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2orf16Q68DN1 1984 aa5□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CITO14578 2027 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANK1P16157 1881 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLXNA3P51805 1871 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 C17orf102A2RUQ5 167 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCAF2A6NFQ2 919 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPOPA6NHQ4 379 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 HAS3O00219 553 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 RFXAPO00287 272 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 NBNO60934 754 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP9AO75110 1047 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 KNG1P01042 644 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBP3P10745 1247 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTN1P12814 892 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCG2P13521 617 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNA2P16389 499 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB27AP51159 221 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPHB1P54762 984 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCAR1P56945 870 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAF1Q13077 416 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPFIA1Q13136 1202 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEDD9Q14511 834 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT8Q16880 541 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOR2AQ5JU69 321 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 METTL7BQ6UX53 244 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNK18Q7Z418 384 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB46Q86UZ6 589 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYOCDQ8IZQ8 938 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP2W1Q8TAV3 490 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAGE1Q8TC20 777 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARNTL2Q8WYA1 636 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLG1Q92896 1179 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP6V0A1Q93050 837 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PWWP2AQ96N64 755 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 AIFM3Q96NN9 605 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP3K14Q99558 947 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 C16orf70Q9BSU1 422 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTG2Q9H4K7 406 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC28A3Q9HAS3 691 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD320Q9NPF0 282 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIC8AQ9NPQ8 531 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SETD4Q9NVD3 440 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MKS1Q9NXB0 559 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUBE1Q9UJT0 475 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCTD3Q9Y597 815 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUMBLQ9Y6R0 609 aa4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 BDP1A6H8Y1 2624 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMCO2A6NFE2 343 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKAP10O43572 662 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHMP2AO43633 222 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 OPHN1O60890 802 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 STAM2O75886 525 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDH8O95206 1070 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PARNO95453 639 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CELA3BP08861 270 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 GHRP10912 638 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF28P17035 718 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ICAM3P32942 547 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 RFC2P35250 354 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADCY8P40145 1251 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 NFATC3Q12968 1075 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ODF1Q14990 250 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERINC5Q86VE9 423 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SESTD1Q86VW0 696 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 HERC6Q8IVU3 1022 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMTC2Q8N394 836 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR48Q8TAF3 677 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 GJA10Q969M2 543 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SDF4Q9BRK5 362 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCTD10Q9H3F6 313 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJC28Q9NX36 388 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 BARHL2Q9NY43 387 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC9A2Q9UBY0 812 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 FTSJ1Q9UET6 329 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS50Q9UI38 385 aa4.98□□□□□ -1.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 DENND4AQ7Z401 1863 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms