RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 PDGFRLQ15198 375 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 ZNF852Q6ZMS4 543 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 SCD5Q86SK9 330 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 SLC35F5Q8WV83 523 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 OSCP1Q8WVF1 389 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 KCTD13Q8WZ19 329 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 ULBP1Q9BZM6 244 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 EBF3Q9H4W6 596 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 LTB4R2Q9NPC1 389 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 CYLDQ9NQC7 956 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 HPS4Q9NQG7 708 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 SIT1Q9Y3P8 196 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 FHOD1Q9Y613 1164 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 WNT6Q9Y6F9 365 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 SHISA7A6NL88 538 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 MAN2B1O00754 1011 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 MED7O43513 233 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 TBX18O95935 607 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 ZBED1O96006 694 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 GLULP15104 373 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 ARSAP15289 507 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 PSEN1P49768 467 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 RGS7P49802 495 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 ADIGQ0VDE8 80 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 RUNX3Q13761 415 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 RAPGEF1Q13905 1077 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 PJA1Q8NG27 643 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 ZNF606Q8WXB4 792 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 FAM3CQ92520 227 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 CFAP97Q9P2B7 532 aa18.96■□□□□ 0.63
HERC3-205ENST00000426683 MYH10P35580 1976 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 COL4A2P08572 1712 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 FAM170BA6NMN3 283 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 LGALS16A8MUM7 142 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 RALAP11233 206 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 ATP1A3P13637 1013 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 LCP1P13796 627 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 UCHL3P15374 230 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 KLK7P49862 253 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 SMYD5Q6GMV2 418 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 PM20D1Q6GTS8 502 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 PMF1Q6P1K2 205 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 DENND1BQ6P3S1 775 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 ARHGAP18Q8N392 663 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 MSANTD3Q96H12 275 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 NELL2Q99435 816 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 CLIC5Q9NZA1 410 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 NUDT5Q9UKK9 219 aa18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 LRRC10BA6NIK2 292 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 PIK3R2O00459 728 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 MDM4O15151 490 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 DCNP07585 359 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 TARSP26639 723 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 CTHP32929 405 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 GPD2P43304 727 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 PTK2Q05397 1052 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 EML3Q32P44 896 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 C10orf120Q5SQS8 335 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 TADA2BQ86TJ2 420 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 CCDC105Q8IYK2 499 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 HSFY1Q96LI6 401 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 LINC00597Q9H2U6 94 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 PLCB1Q9NQ66 1216 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 CNGB3Q9NQW8 809 aa18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 GABBR2O75899 941 aa18.93■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 IRF1P10914 325 aa18.93■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 CLCN1P35523 988 aa18.93■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 UBXN1Q04323 297 aa18.93■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 SYCP1Q15431 976 aa18.93■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 MEA1Q16626 185 aa18.93■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa18.93■□□□□ 0.62
HERC3-205ENST00000426683 KLHDC10Q6PID8 442 aa18.93■□□□□ 0.62
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