RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417497.5

TTC28-AS1-202, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 627 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NAGPAQ9UK23 515 aa14□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PATJQ8NI35 1801 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 M0QYV0 167 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PES1O00541 588 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MDM4O15151 490 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NCAM2O15394 837 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PON1P27169 355 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TKTL1P51854 596 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF132P52740 706 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ARHGAP44Q17R89 818 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 VWA3BQ502W6 1294 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CCDC186Q7Z3E2 898 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ATP2A3Q93084 1043 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ULBP1Q9BZM6 244 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NDST4Q9H3R1 872 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ACP6Q9NPH0 428 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KIAA1257Q9ULG3 409 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 USP3Q9Y6I4 520 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PIK3R2O00459 728 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CHRNB1P11230 501 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RARGP13631 454 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GJA4P35212 333 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 USP8P40818 1118 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RPS9P46781 194 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RGS7P49802 495 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MFAP3P55082 362 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ADIGQ0VDE8 80 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MTAPQ13126 283 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 STX1AQ16623 288 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PKDCCQ504Y2 493 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TCP11X2Q5H9J9 407 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RAB41Q5JT25 222 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C10orf120Q5SQS8 335 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 Q6ZS52 159 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MSANTD3Q96H12 275 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 UBXN6Q9BZV1 441 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SIX2Q9NPC8 291 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CYLDQ9NQC7 956 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ANO10Q9NW15 660 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TAB2Q9NYJ8 693 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 APEX2Q9UBZ4 518 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CNTN6Q9UQ52 1028 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 BECN2A8MW95 431 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LAMTOR5O43504 91 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GABBR2O75899 941 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NFATC1O95644 943 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZBED1O96006 694 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CYP17A1P05093 508 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SETSIPP0DME0 302 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LCP1P13796 627 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PLA2G4AP47712 749 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CNGA2Q16280 664 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CDKAL1Q5VV42 579 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FSTL4Q6MZW2 842 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PMF1Q6P1K2 205 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MIB1Q86YT6 1006 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CHRDQ9H2X0 955 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LRRC4Q9HBW1 653 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FANCLQ9NW38 375 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HELZP42694 1942 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MYO16Q9Y6X6 1858 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 E2F8A0AVK6 867 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RALAP11233 206 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MAGEA9P43362 315 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GALK1P51570 392 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TYRO3Q06418 890 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EFEMP1Q12805 493 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CCINQ13939 588 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LRRC32Q14392 662 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GAS6Q14393 721 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GAB4Q2WGN9 574 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMEM196Q5HYL7 178 aa13.96□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DENND1BQ6P3S1 775 aa13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms