RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 EML3Q32P44 896 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PKDCCQ504Y2 493 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ECT2Q9H8V3 914 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CYLDQ9NQC7 956 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 FANCLQ9NW38 375 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 NAGPAQ9UK23 515 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 COL4A3Q01955 1670 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 RARGP13631 454 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PSEN1P49768 467 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP2A3Q93084 1043 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 SIX2Q9NPC8 291 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF318Q5VUA4 2279 aa22.2■■□□□ 1.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBED1O96006 694 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SETSIPP0DME0 302 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGEA9P43362 315 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 PLA2G4AP47712 749 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 AMPD2Q01433 879 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 TYRO3Q06418 890 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNMA1Q12791 1236 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 NR1H3Q13133 447 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 PON2Q15165 354 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf210Q8IVY1 113 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CPA6Q8N4T0 437 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 KCTD13Q8WZ19 329 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM122AQ96E09 287 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 E2F8A0AVK6 867 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CHRNB1P11230 501 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 RALAP11233 206 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 USP8P40818 1118 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 NHLH1Q02575 133 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 ANGPT1Q15389 498 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 PMF1Q6P1K2 205 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF276Q8N554 614 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 VPS16Q9H269 839 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 BECN2A8MW95 431 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 M0QYV0 167 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 GJA4P35212 333 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 GALK1P51570 392 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 MYL5Q02045 173 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CHFRQ96EP1 664 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 MED7O43513 233 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 NFATC1O95644 943 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 LCP1P13796 627 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 RGS7P49802 495 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT31Q15323 416 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SHC3Q92529 594 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 WBP2Q969T9 261 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 HSFY1Q96LI6 401 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 ACP6Q9NPH0 428 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 OBSL1O75147 1896 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 MDM4O15151 490 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 THAP12O43422 761 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 GABBR2O75899 941 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP4-204ENST00000416021 TPM2P07951 284 aa22.16■■□□□ 1.14
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