RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412722.1

LINC00427-201, long intergenic non-protein coding RNA 427, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00427, Length 430 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00427-201ENST00000412722 NUP133Q8WUM0 1156 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 RFFLQ8WZ73 363 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 TFAP2CQ92754 450 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 SMOQ99835 787 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 SLC46A2Q9BY10 475 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 NOD2Q9HC29 1040 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 PI4KBQ9UBF8 816 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 HDAC5Q9UQL6 1122 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 ZDHHC9Q9Y397 364 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 IRAK3Q9Y616 596 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 CDY1Q9Y6F8 540 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 VCANP13611 3396 aa5.08□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 MEGF6O75095 1541 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 A0A1W2PRX2 142 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 SH3D21A4FU49 640 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 SRGAP2BP0DMP2 458 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 MGAT1P26572 445 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 CCR5P51681 352 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 SEC24CP53992 1094 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 NR1H2P55055 460 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 LOXL3P58215 753 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 DLG4P78352 724 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 KRT17Q04695 432 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 ATP1A4Q13733 1029 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 SURF1Q15526 300 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 RNF151Q2KHN1 245 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 VWA3BQ502W6 1294 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 EFCAB12Q6NXP0 572 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 PRR23BQ6ZRT6 265 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 NEK10Q6ZWH5 1172 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 TMEM57Q8N5G2 664 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 SHCBP1Q8NEM2 672 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 WDR60Q8WVS4 1066 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 GRAMD1AQ96CP6 724 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 HVCN1Q96D96 273 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 PREBQ9HCU5 417 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 ETAA1Q9NY74 926 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 HPSEQ9Y251 543 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 PXDNLA1KZ92 1463 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 UNC80Q8N2C7 3258 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 C10orf71Q711Q0 1435 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 NRAPQ86VF7 1730 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 A6NCN8 305 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 EFCAB8A8MWE9 144 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 DCLK1O15075 740 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 JUPP14923 745 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 RXRAP19793 462 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 CDK7P50613 346 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 NUCB1Q02818 461 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 GPS1Q13098 491 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 KCNAB1Q14722 419 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 ANKRD1Q15327 319 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 METTL24Q5JXM2 366 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 TTC22Q5TAA0 569 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 MANEALQ5VSG8 457 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 MCTP2Q6DN12 878 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 MFSD5Q6N075 450 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 RINT1Q6NUQ1 792 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 FAM111BQ6SJ93 734 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 LAYNQ6UX15 382 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 TTC30AQ86WT1 665 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 XYLT1Q86Y38 959 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 CFAP52Q8N1V2 620 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 TCP11L2Q8N4U5 519 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 USP38Q8NB14 1042 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 CPT1CQ8TCG5 803 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 C3orf49Q96BT1 292 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 MBD6Q96DN6 1003 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
LINC00427-201ENST00000412722 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms