RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393392.6

ANKRD42-203, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD42, Length 2,302 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-203ENST00000393392 VIPAS39Q9H9C1 493 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 LTBP2Q14767 1821 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 DGKIO75912 1065 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 USP17L7P0C7H9 530 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 RAG1P15918 1043 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 CYP2F1P24903 491 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 PCK1P35558 622 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 HDAC4P56524 1084 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 ACAP1Q15027 740 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 SCYL2Q6P3W7 929 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 FUT10Q6P4F1 479 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 DEFB106AQ8N104 65 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 TRIM51Q9BSJ1 452 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 CHST7Q9NS84 486 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 MTUS1Q9ULD2 1270 aa13.05□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 YJEFN3A6XGL0 299 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 E7ENQ6 273 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 SYN3O14994 580 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 KIAA0355O15063 1070 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 KRT7P08729 469 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 RFC2P35250 354 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 SCNN1AP37088 669 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 CDKN2BP42772 138 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 SNX1Q13596 522 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 ODF2Q5BJF6 829 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 RAB41Q5JT25 222 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 EFHC1Q5JVL4 640 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 RTP2Q5QGT7 225 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 LRRC31Q6UY01 552 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 PGLYRP2Q96PD5 576 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 HSF2BPO75031 334 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 IVLP07476 585 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 CARSP49589 748 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 DAOAP59103 153 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 DR1Q01658 176 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 CYP1B1Q16678 543 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 CTXN3Q4LDR2 81 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 DCAF6Q58WW2 860 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 SYPL2Q5VXT5 272 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 STKLD1Q8NE28 680 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 TOP1MTQ969P6 601 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 TBCBQ99426 244 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 TMEM175Q9BSA9 504 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 CWH43Q9H720 699 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 GDF3Q9NR23 364 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
ANKRD42-203ENST00000393392 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 VGLL3A8MV65 326 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 PRPSAP2O60256 369 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 FYNP06241 537 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 FGFR3P22607 806 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 KDELR1P24390 212 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 MCM3P25205 808 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 CHRNA3P32297 505 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 COILP38432 576 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 MATKP42679 507 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 PTGIRP43119 386 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 PTPN9P43378 593 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 ARPP19P56211 112 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 MAP9Q49MG5 647 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 TFDP3Q5H9I0 405 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 MFSD5Q6N075 450 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 BHLHA9Q7RTU4 235 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 CCDC26Q8TAB7 109 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 SCAMP5Q8TAC9 235 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 IFT81Q8WYA0 676 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 MAGEB5Q9BZ81 275 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 RASSF4Q9H2L5 321 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa13.03□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa13.02□□□□□ -0.32
ANKRD42-203ENST00000393392 GRIK1P39086 918 aa13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms