RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 PLA2G4AP47712 749 aa8.96□□□□□ -0.98
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MT-TS1-201ENST00000387416 MFAP3P55082 362 aa8.96□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 TNK2Q07912 1038 aa8.96□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
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MT-TS1-201ENST00000387416 SCML4Q8N228 414 aa8.96□□□□□ -0.98
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MT-TS1-201ENST00000387416 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.96□□□□□ -0.98
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MT-TS1-201ENST00000387416 HOXA6P31267 233 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 GJA4P35212 333 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 MRE11P49959 708 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 COG7P83436 770 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 MTAPQ13126 283 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CCINQ13939 588 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 PON2Q15165 354 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 MAN2A1Q16706 1144 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB41Q5JT25 222 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 HTR3DQ70Z44 454 aa8.95□□□□□ -0.98
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MT-TS1-201ENST00000387416 IRF2BP1Q8IU81 584 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CD101Q93033 1021 aa8.95□□□□□ -0.98
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MT-TS1-201ENST00000387416 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.95□□□□□ -0.98
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MT-TS1-201ENST00000387416 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 NAGPAQ9UK23 515 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.95□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.95□□□□□ -0.98
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MT-TS1-201ENST00000387416 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.95□□□□□ -0.98
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MT-TS1-201ENST00000387416 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1W2PQH9 124 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CYP26A1O43174 497 aa8.94□□□□□ -0.98
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MT-TS1-201ENST00000387416 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CNR2P34972 360 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 SOX9P48436 509 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 GALK1P51570 392 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 TKTL1P51854 596 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF132P52740 706 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 SNX16P57768 344 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 GAD2Q05329 585 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 PDE4CQ08493 712 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 C10orf120Q5SQS8 335 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.94□□□□□ -0.98
MT-TS1-201ENST00000387416 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.94□□□□□ -0.98
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